23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_11759 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_11759  predicted protein  100 
 
 
197 aa  414  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32020  predicted protein  49.59 
 
 
191 aa  112  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0199026 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6725  predicted protein  32.72 
 
 
258 aa  95.5  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9956  predicted protein  32.35 
 
 
200 aa  92.4  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.841338  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37519  predicted protein  32.02 
 
 
309 aa  87.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01873  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
372 aa  86.3  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00820  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22821  predicted protein  31 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92911  predicted protein  30.81 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.846353  normal  0.142563 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1676  Phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 
203 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  0.436187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1396  Phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0105349  normal  0.20859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2243  phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1401  phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0118835 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34534  predicted protein  37.07 
 
 
135 aa  56.6  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04653  conserved hypothetical protein  30.34 
 
 
329 aa  49.7  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.791672 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01218  GPI anchored protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10590)  28.07 
 
 
406 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.392776  normal  0.0162836 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17595  predicted protein  22.69 
 
 
498 aa  45.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.372053 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40227  hypothetical protein  25 
 
 
314 aa  45.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.335478 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56473  phosphoglycerate mutase  28.68 
 
 
314 aa  45.1  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.397399  normal  0.275923 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  24.26 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40176  predicted protein  28.57 
 
 
306 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46353  predicted protein  22.13 
 
 
296 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  33.8 
 
 
228 aa  41.6  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>