More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0435 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 193 aa  396  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  46.39 
 
 		 196 aa  194  7e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  46.84 
 
 		 196 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  44.04 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  41.62 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  36.6 
 
 		 200 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 		 194 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  34.72 
 
 		 214 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2515  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 202 aa  90.5  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279517  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 189 aa  89.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  34.43 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  37.87 
 
 		 222 aa  88.6  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  37.87 
 
 		 222 aa  88.6  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 203 aa  85.9  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  35.56 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  35.67 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.42 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  29.21 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  27.53 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  27.53 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  27.37 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  29.21 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  27.37 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  33.91 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.88 
 
 		 356 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  27.22 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1440  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  26.82 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  26.82 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  28.25 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  33.95 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  29.84 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.62 
 
 		 369 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  36 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  34.05 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  37.33 
 
 		 391 aa  71.2  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  34.19 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  39.17 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  31.9 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  41.9 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  38.36 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  41.9 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  41.9 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  32.9 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  40.54 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  37.66 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.54 
 
 		 365 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.54 
 
 		 365 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.54 
 
 		 365 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  29.7 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  41.18 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  32.56 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.97 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  34 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.75 
 
 		 442 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  37.61 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>