128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2127 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2127  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
215 aa  448  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00711318  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0772  phosphoglycerate mutase  60.47 
 
 
215 aa  265  2.9999999999999995e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0934  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  60.75 
 
 
215 aa  260  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0265  Phosphoglycerate mutase  58.69 
 
 
214 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0266  Phosphoglycerate mutase  58.69 
 
 
214 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3985  Phosphoglycerate mutase  58.49 
 
 
212 aa  244  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.634777 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43298  predicted protein  25.52 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57574  putative transcription initiation factor  27.16 
 
 
439 aa  69.7  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.625866 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  32.71 
 
 
216 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  25.94 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  25.6 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
216 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  28.3 
 
 
215 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  28.3 
 
 
215 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  28.3 
 
 
215 aa  55.5  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34217  predicted protein  29.06 
 
 
268 aa  55.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.105631  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  29.67 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  27.78 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  28.91 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  27.78 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  29.12 
 
 
203 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  29.12 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  29.12 
 
 
205 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  24.16 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  26.46 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  24.16 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  39.56 
 
 
209 aa  52.4  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  29.8 
 
 
224 aa  52  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  27.01 
 
 
215 aa  51.6  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  27.01 
 
 
215 aa  51.6  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  27.01 
 
 
215 aa  51.6  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  27.01 
 
 
215 aa  51.6  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  27.01 
 
 
215 aa  51.6  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  25.49 
 
 
232 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  26.97 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  28.3 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  39.33 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  43.1 
 
 
440 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.37 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  37.18 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  37.18 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  37.18 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 
209 aa  50.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  28.68 
 
 
226 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  28.68 
 
 
226 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  29.72 
 
 
216 aa  49.3  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 
223 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  27.62 
 
 
203 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10663  conserved hypothetical protein  33 
 
 
616 aa  48.9  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.421604  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  25.97 
 
 
215 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  31.79 
 
 
243 aa  48.5  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  25.97 
 
 
215 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81572  predicted protein  23.55 
 
 
457 aa  48.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.526863  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  29.28 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  26.89 
 
 
215 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  26.89 
 
 
215 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  37.21 
 
 
202 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  37.21 
 
 
202 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  37.21 
 
 
202 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  26.89 
 
 
215 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  26.89 
 
 
215 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  26.89 
 
 
215 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  26.89 
 
 
215 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  26.89 
 
 
215 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  26.89 
 
 
215 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
219 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  25.96 
 
 
427 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  25.95 
 
 
215 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  26.39 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  28.68 
 
 
227 aa  46.2  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 
241 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00908  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G15740)  21.37 
 
 
354 aa  45.8  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0205604  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  26.52 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  25 
 
 
212 aa  45.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  25 
 
 
233 aa  45.1  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2465  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.97 
 
 
152 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.101249  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2929  phosphoglycerate mutase  26.64 
 
 
198 aa  45.1  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.3 
 
 
200 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.3 
 
 
200 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  31.3 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.85 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  48.15 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  24.08 
 
 
240 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  27.69 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 
235 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  25.33 
 
 
207 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  31.39 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  23.91 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1144  phosphoglycerate mutase family protein  26.11 
 
 
193 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.445332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4206  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.43 
 
 
150 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.550023 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  24.67 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  26.06 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
245 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  24.22 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>