211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13871 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13871  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5033  phosphoglycerate mutase  68.1 
 
 
228 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.533866  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5121  phosphoglycerate mutase  68.1 
 
 
228 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5414  phosphoglycerate mutase  68.1 
 
 
228 aa  295  6e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  0.969377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5661  phosphoglycerate mutase  63.03 
 
 
234 aa  291  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0883808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  64.44 
 
 
233 aa  290  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0146  Phosphoglycerate mutase  48.13 
 
 
211 aa  178  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0176  Phosphoglycerate mutase  45.65 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  44.78 
 
 
203 aa  138  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
223 aa  106  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 
224 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  36.18 
 
 
224 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 
224 aa  105  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0219  Phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 
238 aa  102  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  35 
 
 
202 aa  94.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.19 
 
 
213 aa  72  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 
215 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 
215 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 
207 aa  68.6  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 
207 aa  62  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  29.48 
 
 
214 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1972  phosphoglycerate mutase  30.58 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4577  phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 
443 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.21 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  26.53 
 
 
209 aa  58.5  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5230  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 
231 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.696927 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  30.05 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5141  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5522  phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  31.91 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
223 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
212 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 
214 aa  56.2  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
212 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  30.6 
 
 
206 aa  55.5  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
220 aa  55.1  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  23.53 
 
 
208 aa  55.1  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  22 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.34 
 
 
205 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1440  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.11 
 
 
209 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  32.58 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  30.34 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  33.33 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  34.08 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  31.38 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  31.38 
 
 
207 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  29.78 
 
 
212 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.65 
 
 
382 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  32.02 
 
 
208 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  29.78 
 
 
212 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  30.98 
 
 
211 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  28.82 
 
 
209 aa  52  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 
224 aa  51.6  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1617  Phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00194146  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  25.67 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45200  predicted protein  27.83 
 
 
547 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13424  lipoprotein lpqD  26.21 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.77779e-17  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3680  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  27.94 
 
 
218 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  30.98 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  30.9 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  26 
 
 
218 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  28.57 
 
 
206 aa  49.7  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  27.98 
 
 
201 aa  49.7  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  24.57 
 
 
209 aa  49.7  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  24.63 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  28.57 
 
 
207 aa  49.7  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0291  phosphoglycerate mutase  26.18 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0246325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 
240 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
200 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  28.63 
 
 
241 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  31.9 
 
 
212 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 
207 aa  48.9  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
205 aa  48.9  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  24.31 
 
 
201 aa  48.9  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
214 aa  48.9  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  24.31 
 
 
201 aa  48.9  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10768  PE-PGRS family protein  28.5 
 
 
584 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00003155  normal  0.917893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 
224 aa  48.5  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  25.82 
 
 
205 aa  48.5  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25 
 
 
442 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  24.38 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  23.4 
 
 
452 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  26.88 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>