270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5414 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5033  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
228 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.533866  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5121  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
228 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5414  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
228 aa  457  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  0.969377 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  68.67 
 
 
233 aa  314  6e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5661  phosphoglycerate mutase  67.09 
 
 
234 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0883808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13871  phosphoglycerate mutase  68.1 
 
 
232 aa  308  5e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0146  Phosphoglycerate mutase  47.91 
 
 
211 aa  182  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0176  Phosphoglycerate mutase  48.54 
 
 
225 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  44 
 
 
203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  37.93 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 
224 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  37.31 
 
 
202 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0219  Phosphoglycerate mutase  37.68 
 
 
238 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  36.82 
 
 
223 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5141  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5230  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.696927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5522  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.23 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4577  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 
443 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1756  phosphoglycerate mutase-like protein  25 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  36.09 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  29.48 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1972  phosphoglycerate mutase  31.86 
 
 
238 aa  62  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  31.51 
 
 
207 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
445 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
212 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.84 
 
 
369 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  25.88 
 
 
200 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  26.47 
 
 
200 aa  59.7  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  39.04 
 
 
391 aa  58.9  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  34.94 
 
 
220 aa  58.5  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  29.29 
 
 
206 aa  58.5  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  28.82 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  25.88 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  25.88 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.35 
 
 
442 aa  57  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0724  Phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0153538  normal  0.0816175 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.94 
 
 
442 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 
209 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.88 
 
 
382 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 
204 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3207  phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 
231 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155022  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.11 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.16 
 
 
212 aa  55.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  25.82 
 
 
213 aa  55.5  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.49 
 
 
444 aa  55.5  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  26.82 
 
 
201 aa  55.5  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
213 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  26.82 
 
 
201 aa  55.5  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.58 
 
 
442 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.49 
 
 
442 aa  55.1  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 
207 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 
218 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  29.55 
 
 
221 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.74 
 
 
443 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  26.01 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  27.75 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13424  lipoprotein lpqD  26.37 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.77779e-17  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
214 aa  53.9  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  33.13 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  35.47 
 
 
241 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  27.17 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 
226 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 
447 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  32.55 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 
234 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  25.95 
 
 
452 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1617  Phosphoglycerate mutase  25.62 
 
 
199 aa  53.1  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00194146  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 
211 aa  53.1  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  25.15 
 
 
188 aa  52.8  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  29.12 
 
 
211 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 
212 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  26.44 
 
 
228 aa  52.4  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 
199 aa  52  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 
213 aa  52  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  31.93 
 
 
204 aa  52  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 
215 aa  52  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>