More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1617 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1617  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 199 aa  411  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00194146  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  34.8 
 
 		 209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 208 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  35.86 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 202 aa  98.2  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 233 aa  98.2  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 217 aa  97.8  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 		 227 aa  96.3  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 		 240 aa  95.9  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 217 aa  95.1  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 201 aa  95.1  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 201 aa  95.1  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.3 
 
 		 213 aa  94.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 		 200 aa  93.6  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 213 aa  92.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 211 aa  91.7  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 224 aa  90.5  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 225 aa  90.5  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 192 aa  88.6  6e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  28.34 
 
 		 220 aa  86.3  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  28.28 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 228 aa  85.9  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 210 aa  85.9  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 229 aa  85.1  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 222 aa  84.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.2 
 
 		 205 aa  84.7  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  30.77 
 
 		 222 aa  84.7  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  29.68 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  29.87 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  29.87 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.69 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.69 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  34.64 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  26.24 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  29.87 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  25.82 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  25.82 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  25.82 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1756  phosphoglycerate mutase-like protein  31.61 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  27.45 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  27.69 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  30.18 
 
 		 219 aa  77.8  0.00000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  28.28 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.17 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  25.73 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  28.08 
 
 		 440 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  30.61 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.41 
 
 		 442 aa  75.5  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.2 
 
 		 442 aa  75.5  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  30.32 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.29 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2108  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  29.61 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.317681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  30.92 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  26.29 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  26.29 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  26.29 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  27.55 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  26.29 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  26.8 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  28.08 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  29 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1132  phosphoglycerate mutase  44.33 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.41 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  26.29 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  24.62 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  29.8 
 
 		 378 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  33.33 
 
 		 452 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.87 
 
 		 444 aa  72  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  28.71 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>