52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45200 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45200  predicted protein  100 
 
 		 547 aa  1142    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6517  predicted protein  39.29 
 
 		 202 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.454064  normal  0.773681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0608  Phosphoglycerate mutase  38.64 
 
 		 217 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1314  phosphoglycerate mutase  36.73 
 
 		 226 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04983  phosphoglycerate mutase family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10050)  37.39 
 
 		 651 aa  140  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85057  predicted protein  36.63 
 
 		 276 aa  110  7.000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2199  Phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 249 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1988  Phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 		 249 aa  93.6  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6372  phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3699  Phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155498  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0181  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.45 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0743  phosphoglycerate mutase  28.81 
 
 		 252 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  25.93 
 
 		 259 aa  57  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  23.81 
 
 		 243 aa  54.3  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5661  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 234 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0883808 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  27.73 
 
 		 201 aa  53.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  28.19 
 
 		 233 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0052  phosphoglycerate mutase family protein  26.29 
 
 		 196 aa  52  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0651  phosphoglycerate mutase family protein  27.75 
 
 		 276 aa  51.2  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13871  phosphoglycerate mutase  27.83 
 
 		 232 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  24.12 
 
 		 215 aa  50.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  24.12 
 
 		 215 aa  50.8  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  24.12 
 
 		 215 aa  50.8  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  25.87 
 
 		 233 aa  50.4  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1390  phosphoglycerate mutase 1 family protein  27.27 
 
 		 235 aa  50.4  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  25.36 
 
 		 207 aa  50.4  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0120  phosphoglycerate mutase  26.64 
 
 		 262 aa  50.4  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  25.43 
 
 		 206 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  26.36 
 
 		 180 aa  48.5  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1302  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 245 aa  48.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106982  decreased coverage  0.000409559 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  25.51 
 
 		 236 aa  47.8  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 189 aa  47.8  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 412 aa  47  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.43 
 
 		 442 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 207 aa  47  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0435  phosphoglycerate mutase  26.53 
 
 		 193 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0424  phosphoglycerate mutase  26.53 
 
 		 193 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.845746  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0332  phosphoglycerate mutase 1  28.92 
 
 		 229 aa  46.6  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000043605 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  23.56 
 
 		 215 aa  46.2  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  28.12 
 
 		 213 aa  45.8  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  25.96 
 
 		 258 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0310  phosphoglycerate mutase  27.14 
 
 		 222 aa  45.8  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  26.03 
 
 		 214 aa  45.8  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.25 
 
 		 442 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  29.79 
 
 		 204 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  25.89 
 
 		 198 aa  45.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  27.75 
 
 		 224 aa  44.7  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3846  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 194 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  23.61 
 
 		 208 aa  44.3  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 		 241 aa  43.9  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 213 aa  43.9  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  25.51 
 
 		 196 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>