295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0120 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0120  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
262 aa  524  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  68.03 
 
 
258 aa  339  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1302  Phosphoglycerate mutase  51.69 
 
 
245 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106982  decreased coverage  0.000409559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1588  Phosphoglycerate mutase  57.58 
 
 
234 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0181  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  47.66 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0743  phosphoglycerate mutase  45.06 
 
 
252 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702644  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  43.78 
 
 
259 aa  183  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3699  Phosphoglycerate mutase  52.13 
 
 
253 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155498  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1986  Phosphoglycerate mutase  52.34 
 
 
244 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000793068  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9413  hypothetical protein  42.73 
 
 
242 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4997  Phosphoglycerate mutase  43.05 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118057  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0651  phosphoglycerate mutase family protein  29.82 
 
 
276 aa  80.1  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2199  Phosphoglycerate mutase  35.4 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
224 aa  73.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1988  Phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 
412 aa  72.4  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.44 
 
 
196 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 
213 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6517  predicted protein  32.04 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.454064  normal  0.773681 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03630  6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-bisphosphatase bifunctional enzyme, putative  30.65 
 
 
658 aa  67.4  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  30.06 
 
 
196 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.87 
 
 
378 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 
196 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1929  phosphoglycerate mutase family protein  30.06 
 
 
196 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  30.06 
 
 
196 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 
196 aa  63.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  30.06 
 
 
196 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  33.81 
 
 
227 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  29.48 
 
 
196 aa  63.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 
224 aa  62.4  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  32.21 
 
 
226 aa  62  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
411 aa  61.6  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.79 
 
 
378 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  29.72 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2160  phosphoglycerate mutase family protein  30.06 
 
 
196 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  30.33 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  31.73 
 
 
226 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.12 
 
 
382 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  24.66 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  27.91 
 
 
196 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 
237 aa  60.1  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  30.33 
 
 
212 aa  59.7  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 
232 aa  58.5  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0998048 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10844  hypothetical protein similar to fructose-2,6-bisphosphatase (Eurofung)  30.6 
 
 
443 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  32.6 
 
 
383 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  27.56 
 
 
190 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  28.49 
 
 
196 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 
378 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
214 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 
212 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  30.33 
 
 
221 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  30.33 
 
 
221 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
214 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
220 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  28.44 
 
 
220 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.88 
 
 
222 aa  55.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 
223 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.88 
 
 
222 aa  55.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 
223 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  29.24 
 
 
203 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 
370 aa  55.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  29.78 
 
 
224 aa  55.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  32.14 
 
 
203 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  29.54 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0052  phosphoglycerate mutase family protein  25.82 
 
 
196 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  27.27 
 
 
205 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 
195 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  29.54 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  29.54 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  29.54 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68318  fructose-2,6-bisphosphatase (FBP26)  28.18 
 
 
456 aa  53.9  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.995791  normal  0.428172 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 
190 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  29.54 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  29.38 
 
 
229 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 
213 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  31.53 
 
 
204 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  29.38 
 
 
220 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  33.03 
 
 
213 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 
226 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 
195 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 
226 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 
226 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  29.38 
 
 
220 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  25.59 
 
 
203 aa  53.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  28.65 
 
 
203 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 
197 aa  53.1  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  26.99 
 
 
191 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>