157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4997 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4997  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 238 aa  463  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0120  phosphoglycerate mutase  43.05 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  41.26 
 
 		 258 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0743  phosphoglycerate mutase  40.71 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1302  Phosphoglycerate mutase  43.78 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106982  decreased coverage  0.000409559 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0181  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.64 
 
 		 266 aa  128  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3699  Phosphoglycerate mutase  45.97 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155498  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  37.96 
 
 		 259 aa  121  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9413  hypothetical protein  43.4 
 
 		 242 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1588  Phosphoglycerate mutase  38.86 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1986  Phosphoglycerate mutase  43.72 
 
 		 244 aa  99.8  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000793068  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0651  phosphoglycerate mutase family protein  30.1 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  28.83 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  32.61 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  25.33 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.07 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  27.17 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2160  phosphoglycerate mutase family protein  26.37 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  34.22 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  25.82 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  30.61 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1929  phosphoglycerate mutase family protein  25.82 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  25.82 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  29.6 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  25.82 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  31.68 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  25.82 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1314  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  28.75 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  25.27 
 
 		 196 aa  52.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  27.81 
 
 		 213 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  25.41 
 
 		 196 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17495  bifunctional 6-phosphofructo-2-kinase  27.36 
 
 		 540 aa  52  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1988  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03630  6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-bisphosphatase bifunctional enzyme, putative  25.79 
 
 		 658 aa  50.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.97 
 
 		 378 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  33.04 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 		 391 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  28.67 
 
 		 198 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  29.89 
 
 		 189 aa  50.4  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  27.35 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  23.2 
 
 		 196 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  27.35 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  25.27 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  25.76 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  29.44 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 229 aa  49.3  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  25.53 
 
 		 203 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 411 aa  48.5  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  31.76 
 
 		 208 aa  48.5  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 		 189 aa  48.5  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.27 
 
 		 442 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  23.73 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  32.42 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68318  fructose-2,6-bisphosphatase (FBP26)  25.31 
 
 		 456 aa  47  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.995791  normal  0.428172 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  25.65 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  30.86 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 243 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2199  Phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  27.94 
 
 		 193 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  27.15 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  25 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.61 
 
 		 378 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  30.3 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.45 
 
 		 382 aa  45.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  28.81 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  32.22 
 
 		 203 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 190 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  30.53 
 
 		 208 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>