160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2199 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2199  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
249 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1988  Phosphoglycerate mutase  93.12 
 
 
249 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6372  phosphoglycerate mutase  36.29 
 
 
268 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6517  predicted protein  34.76 
 
 
202 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.454064  normal  0.773681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0608  Phosphoglycerate mutase  35.24 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04983  phosphoglycerate mutase family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10050)  31.48 
 
 
651 aa  96.7  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1314  phosphoglycerate mutase  31.8 
 
 
226 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45200  predicted protein  30.57 
 
 
547 aa  94.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3699  Phosphoglycerate mutase  34.72 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155498  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0120  phosphoglycerate mutase  35.4 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  33.33 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0743  phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702644  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1588  Phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0424  phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.845746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0435  phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1302  Phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106982  decreased coverage  0.000409559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  30.05 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85057  predicted protein  32.86 
 
 
276 aa  64.7  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0181  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.16 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 
215 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 
215 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 
215 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 
215 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 
215 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.19 
 
 
200 aa  62.8  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.73 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.73 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 
204 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  28.11 
 
 
438 aa  59.3  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  27.05 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  27.05 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  27.05 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  27.05 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  27.05 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  27.05 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  27.05 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  27.05 
 
 
215 aa  58.5  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0651  phosphoglycerate mutase family protein  29.74 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.27 
 
 
442 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9413  hypothetical protein  31.79 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 
391 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  26.57 
 
 
215 aa  56.6  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.14 
 
 
205 aa  56.2  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  27.36 
 
 
201 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  27.36 
 
 
201 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0052  phosphoglycerate mutase family protein  30.41 
 
 
196 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
201 aa  55.5  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 
211 aa  55.5  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 
217 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 
216 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  35.57 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  34.88 
 
 
383 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30 
 
 
449 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  25.36 
 
 
188 aa  52.8  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 
212 aa  52.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.29 
 
 
443 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.69 
 
 
442 aa  52  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  26.49 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.91 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  29.38 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1516  phosphoglycerate mutase  27.43 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.481804 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  28 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  28.3 
 
 
215 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 
402 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  26.44 
 
 
199 aa  50.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  27 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
214 aa  49.7  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  27.13 
 
 
241 aa  49.7  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 
194 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  25.82 
 
 
201 aa  49.7  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.2 
 
 
382 aa  48.9  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03630  6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-bisphosphatase bifunctional enzyme, putative  28.49 
 
 
658 aa  48.9  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.88 
 
 
442 aa  48.9  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  27.18 
 
 
195 aa  48.9  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 
222 aa  48.5  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29.9 
 
 
222 aa  48.5  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  29.95 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 
200 aa  48.5  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0965  Phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 
231 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564706  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5270  phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 
225 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.851193  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0332  phosphoglycerate mutase 1  25.26 
 
 
229 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000043605 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2680  phosphoglycerate mutase 1 family  27.47 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  30 
 
 
199 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 
198 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  28.11 
 
 
370 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  27.01 
 
 
412 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.67 
 
 
196 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  28.42 
 
 
212 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  26.11 
 
 
211 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  32.45 
 
 
197 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 
227 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  27.07 
 
 
207 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>