More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0052 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0052  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0435  phosphoglycerate mutase  62.18 
 
 		 193 aa  248  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0424  phosphoglycerate mutase  62.18 
 
 		 193 aa  248  4e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.845746  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  32.09 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  31.02 
 
 		 201 aa  85.5  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_002620  TC0095  phosphoglyceromutase  27.78 
 
 		 226 aa  83.2  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.597303  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  31.12 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0310  phosphoglycerate mutase  29.25 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  28.57 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  30.49 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  30.61 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  30.1 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.18 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  31.64 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 213 aa  77.8  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  30.22 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  30.34 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  30.34 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  29.21 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  30.34 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  31.4 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  31.4 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.22 
 
 		 442 aa  75.5  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  27.27 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  29.78 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  31.11 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0291  phosphoglycerate mutase  27.96 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0246325  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  29.25 
 
 		 246 aa  74.3  0.0000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  29.78 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  28.06 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  28.9 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  29.41 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  29.78 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1596  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0120302  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  29.78 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  28.38 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  29.78 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  26.77 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0494  phosphoglyceromutase  26.77 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.443211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  28.96 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  27.46 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  27.89 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48292  phosphoglycerate mutase  27.06 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  28.44 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 449 aa  72.4  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  27.04 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  27.04 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  27.03 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  28.63 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  29.25 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 217 aa  72  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  27.04 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  28.82 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 215 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  27.04 
 
 		 212 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  29.02 
 
 		 250 aa  72  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  30.77 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68318  fructose-2,6-bisphosphatase (FBP26)  34.05 
 
 		 456 aa  72  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.995791  normal  0.428172 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  26.46 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  28.82 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  28.12 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  27.42 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  30.23 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>