More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_48292 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_48292  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  45.63 
 
 		 248 aa  218  6e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0468  phosphoglyceromutase  43.55 
 
 		 333 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.835759  normal  0.503349 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03670  phosphoglycerate mutase  42.41 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.906966  normal  0.209214 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03720  phosphoglycerate mutase  42.15 
 
 		 252 aa  211  7e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00729363  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  43.08 
 
 		 248 aa  211  7.999999999999999e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  42.34 
 
 		 249 aa  208  7e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  48.09 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  40.94 
 
 		 249 aa  207  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  42.74 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  42.74 
 
 		 247 aa  204  8e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  43.48 
 
 		 249 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  43.48 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0847  phosphoglyceromutase  41.11 
 
 		 248 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  43.48 
 
 		 249 aa  203  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0891  phosphoglyceromutase  40.78 
 
 		 250 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00049207 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  41.9 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  42.91 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  41.2 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  41.94 
 
 		 247 aa  202  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  42.34 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0732  phosphoglycerate mutase 1 family  42.75 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2972  phosphoglycerate mutase 1 family  42.29 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  42.91 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  41.6 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02670  phosphoglycerate mutase  43.93 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  43.97 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  43.97 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0994  phosphoglycerate mutase 1 family  43.03 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  43.97 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  44.4 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0958  Bisphosphoglycerate mutase  41.04 
 
 		 247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  43.08 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6148  phosphoglyceromutase  43.95 
 
 		 245 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.334482  normal  0.848752 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  44.87 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  44 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  41.37 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0651  phosphoglycerate mutase 1 family  42.8 
 
 		 248 aa  195  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0496  phosphoglycerate mutase 1 family  42.17 
 
 		 247 aa  195  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.455865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2911  phosphoglyceromutase  40.64 
 
 		 247 aa  195  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1779  phosphoglyceromutase  41.18 
 
 		 246 aa  194  8.000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10497  phosphoglyceromutase  45.34 
 
 		 249 aa  194  9e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.07521e-44  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  44.4 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  44.4 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  39.76 
 
 		 249 aa  194  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  44.4 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4043  phosphoglyceromutase  40.87 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0829  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220031  normal  0.96316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8222  phosphoglyceromutase  39.29 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  43.1 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  44.4 
 
 		 250 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0721  phosphoglyceromutase  40.47 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  44.4 
 
 		 250 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  42.67 
 
 		 250 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  42.91 
 
 		 249 aa  193  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31910  phosphoglycerate mutase  41.04 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  43.1 
 
 		 250 aa  192  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  41.81 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0394  phosphoglycerate mutase 1 family protein  39.92 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  40.71 
 
 		 248 aa  192  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  43.97 
 
 		 250 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  43.97 
 
 		 250 aa  192  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  43.1 
 
 		 234 aa  192  7e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  43.97 
 
 		 250 aa  192  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  43.97 
 
 		 250 aa  192  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  43.97 
 
 		 250 aa  192  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  43.97 
 
 		 250 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  43.97 
 
 		 250 aa  192  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  43.97 
 
 		 250 aa  192  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08870  phosphoglycerate mutase  42.29 
 
 		 248 aa  192  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0709745  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  38.96 
 
 		 247 aa  191  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  41.43 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  43.53 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0654  phosphoglycerate mutase 1 family  41.27 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247226  hitchhiker  0.0000836883 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  39.92 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4605  phosphoglycerate mutase 1 family  41.53 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  41.5 
 
 		 249 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  41.81 
 
 		 250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2086  phosphoglycerate mutase 1 family  40.51 
 
 		 248 aa  189  4e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.574937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0697  phosphoglycerate mutase 1 family  43.55 
 
 		 278 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0772  phosphoglycerate mutase 1 family  40.24 
 
 		 601 aa  189  5.999999999999999e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0084  phosphoglycerate mutase 1 family protein  45.53 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0773  phosphoglycerate mutase 1 family  40 
 
 		 252 aa  188  9e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.9005 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  40.24 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  39.15 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0659  phosphoglycerate mutase  44.68 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  44.05 
 
 		 229 aa  187  2e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0672  phosphoglycerate mutase  44.68 
 
 		 248 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  39.92 
 
 		 248 aa  186  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0652  phosphoglycerate mutase  45.11 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.507635 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  41.35 
 
 		 250 aa  185  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  37.98 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  42.99 
 
 		 228 aa  185  7e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4931  phosphoglycerate mutase 1 family  39.84 
 
 		 247 aa  184  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  41.81 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1523  phosphoglycerate mutase 1 family  41.77 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  38.4 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  40.93 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0075  phosphoglycerate mutase  42.29 
 
 		 252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  40.43 
 
 		 237 aa  183  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>