18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85057 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_85057  predicted protein  100 
 
 
276 aa  579  1e-164  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04983  phosphoglycerate mutase family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10050)  54.49 
 
 
651 aa  187  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1314  phosphoglycerate mutase  44.91 
 
 
226 aa  125  7e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6517  predicted protein  41.38 
 
 
202 aa  112  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.454064  normal  0.773681 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45200  predicted protein  36.63 
 
 
547 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0608  Phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 
217 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6372  phosphoglycerate mutase  28.3 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2199  Phosphoglycerate mutase  32.86 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1988  Phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3699  Phosphoglycerate mutase  30.83 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155498  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0743  phosphoglycerate mutase  28.15 
 
 
252 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702644  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 
216 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  22.3 
 
 
208 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0120  phosphoglycerate mutase  36.17 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1446  molybdopterin binding domain protein  31.71 
 
 
276 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00634302  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  23.65 
 
 
259 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0052  phosphoglycerate mutase family protein  29.73 
 
 
196 aa  42.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>