191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5661 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5661  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 234 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0883808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  80 
 
 		 233 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5033  phosphoglycerate mutase  67.09 
 
 		 228 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.533866  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5121  phosphoglycerate mutase  67.09 
 
 		 228 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5414  phosphoglycerate mutase  67.09 
 
 		 228 aa  300  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  0.969377 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13871  phosphoglycerate mutase  63.03 
 
 		 232 aa  291  8e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0176  Phosphoglycerate mutase  48.07 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116131  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0146  Phosphoglycerate mutase  47.51 
 
 		 211 aa  169  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  39.81 
 
 		 203 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  34.93 
 
 		 224 aa  108  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  36.19 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  37.07 
 
 		 202 aa  96.3  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  35.12 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0219  Phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1972  phosphoglycerate mutase  32.38 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5522  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5141  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5230  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.696927 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 202 aa  62  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1756  phosphoglycerate mutase-like protein  26.7 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  24.26 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 445 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  27.86 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 		 452 aa  55.1  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  30.34 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  26.96 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 449 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  31.53 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0965  Phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564706  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  29.28 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  24.85 
 
 		 207 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45200  predicted protein  30.73 
 
 		 547 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  26.55 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  28.37 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  28.96 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6517  predicted protein  30.34 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.454064  normal  0.773681 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37572  predicted protein  31.75 
 
 		 977 aa  51.6  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.421794  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.07 
 
 		 442 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  26.52 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5140  Phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.97 
 
 		 442 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  26.52 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  25.14 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13424  lipoprotein lpqD  24.52 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.77779e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  28.91 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  30.6 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 391 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  26.47 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.13 
 
 		 442 aa  49.7  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  28.65 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.27 
 
 		 442 aa  48.9  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  29.67 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  25.43 
 
 		 201 aa  48.9  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  25.5 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  29.67 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  25.43 
 
 		 201 aa  48.9  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  24.77 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 		 235 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  27.01 
 
 		 447 aa  48.5  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  25.7 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3680  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 186 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  25.56 
 
 		 448 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  23.92 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  30.6 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.47 
 
 		 444 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.57 
 
 		 442 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1440  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  25.51 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  29.57 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.42 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  23.3 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.11 
 
 		 443 aa  47.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>