105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4450 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4450  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 208 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191223 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5383  phosphoglycerate mutase family protein  66.67 
 
 		 204 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5116  phosphoglycerate mutase  50.65 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0965  Phosphoglycerate mutase  42.24 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564706  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3846  phosphoglycerate mutase  40.59 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5585  Phosphoglycerate mutase  48.41 
 
 		 209 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393552  normal  0.0995735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0304  phosphoglycerate mutase  38.07 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.484417  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1844  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000187954  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  29.03 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2108  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  30.19 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.317681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  27.61 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1516  phosphoglycerate mutase  29.48 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.481804 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  27.33 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  27.33 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3303  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  27.33 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  41.43 
 
 		 448 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  41.43 
 
 		 448 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  28.76 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  26.8 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  29.63 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  29.09 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.8 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.8 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  26.71 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  26.71 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  26.71 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  26.71 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  27.45 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  29.09 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  29.09 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  28.3 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  23.2 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0116  Phosphoglycerate mutase  29.48 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128968  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.39 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  26.13 
 
 		 190 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0724  Phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0153538  normal  0.0816175 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.93 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  25.93 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  25.93 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  28.92 
 
 		 202 aa  44.7  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4088  phosphohistidine phosphatase, SixA  32.74 
 
 		 165 aa  44.7  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  28.83 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0181  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  25.41 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  25.77 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  26.19 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  25.93 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  25.93 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  25.93 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  26.19 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  27.56 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  25.63 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  26.26 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  27.56 
 
 		 226 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  28.98 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  26.51 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  26.8 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  27.16 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  27.71 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 370 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  26.09 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0332  phosphoglycerate mutase 1  32.04 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000043605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0120  phosphoglycerate mutase  24.46 
 
 		 262 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  28.31 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  25.23 
 
 		 214 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  25.56 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0310  phosphoglycerate mutase  23.96 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  25.77 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  38.71 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 		 226 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  28.83 
 
 		 220 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 		 226 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 		 226 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  37.31 
 
 		 190 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 215 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  37.88 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 196 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 215 aa  42  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  29.45 
 
 		 209 aa  42  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5661  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 234 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0883808 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 214 aa  42  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 		 220 aa  41.6  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>