More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1185 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 191 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  69.68 
 
 		 186 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.36 
 
 		 212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1834  Phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2263  phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 		 253 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.704103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3706  Phosphoglycerate mutase  37.69 
 
 		 251 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175906  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3207  phosphoglycerate mutase  37.19 
 
 		 251 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3632  phosphoglycerate mutase  43.01 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0727435  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0187  Phosphoglycerate mutase  38.61 
 
 		 229 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460351  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3479  phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 		 262 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3653  phosphoglycerate mutase  38.61 
 
 		 249 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00889427  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 		 226 aa  94.7  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 190 aa  94.7  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5099  putative phosphoglycerate mutase family protein  35.82 
 
 		 235 aa  92.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0603  hypothetical protein  36.27 
 
 		 192 aa  89.4  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0480  phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393842  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2256  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 192 aa  89  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00135316  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  34.22 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2980  hypothetical protein  35.64 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 		 183 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  34.39 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  38.75 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.38 
 
 		 378 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 		 208 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  37.69 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  29.51 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  31.61 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.02 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.77 
 
 		 378 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  28.02 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  28.02 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  29.26 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  29.51 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  28.02 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  28.02 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  39.58 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  29.51 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  29.51 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  27.87 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  34.69 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  29.67 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 214 aa  67  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  28.32 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  28.02 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  28.02 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  36.61 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.67 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  32.05 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 402 aa  65.1  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1031  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  34.67 
 
 		 249 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  29.87 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  32.79 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.84 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  38.85 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  38.85 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  36.91 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  38.85 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  27.9 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  32.75 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  28.28 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  33.87 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.33 
 
 		 369 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  28.36 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>