More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2602 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 197 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  76.77 
 
 		 198 aa  275  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  55.67 
 
 		 191 aa  176  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  48.95 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  49.73 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  49.73 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  48.13 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  48.66 
 
 		 196 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  48.13 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  43.68 
 
 		 187 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  39.27 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  39.89 
 
 		 185 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  39.79 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  40.21 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  40.21 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  39.68 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.05 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3495  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 201 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  38.62 
 
 		 183 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2243  phosphoglycerate mutase  39.23 
 
 		 200 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580573  normal  0.494376 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 		 237 aa  95.5  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 191 aa  94.7  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 370 aa  88.2  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34.74 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 391 aa  69.3  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 		 402 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  40.65 
 
 		 440 aa  68.6  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.97 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  34.94 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  39.1 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.11 
 
 		 369 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  27.17 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  38.17 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  30.73 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  24.46 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.99 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  37.59 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  26.9 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  26.9 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.16 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  36.21 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  35.76 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  35.11 
 
 		 452 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  37.59 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 411 aa  62  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 223 aa  62  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.68 
 
 		 378 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  35.23 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  32.78 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  37.31 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.89 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  30.9 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3632  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0727435  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  30.21 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.56 
 
 		 382 aa  58.2  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  25.26 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  36.84 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  25.26 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  34.55 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  34.55 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1805  Phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.622206  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.63 
 
 		 356 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  35.29 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 241 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.94 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.94 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  23.62 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>