175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2243 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2243  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580573  normal  0.494376 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3495  phosphoglycerate mutase  95.5 
 
 		 201 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  83.24 
 
 		 179 aa  302  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  70.39 
 
 		 179 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  45.3 
 
 		 189 aa  138  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  49.23 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  40.44 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  39.04 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  39.04 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 185 aa  101  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  39.04 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  39.23 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 184 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  42.2 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  34.05 
 
 		 184 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  35.63 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.93 
 
 		 195 aa  88.2  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  41.48 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  37.12 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  34.32 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  34.32 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  42.57 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1654  putative phosphoglycerate mutase  37.19 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.32 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  28.26 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  26.55 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  28.39 
 
 		 401 aa  58.9  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  35.77 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  27.05 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 		 378 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  39.25 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  41.98 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  22.93 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  28.15 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  33.56 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  34.07 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.37 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  22.93 
 
 		 442 aa  55.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.33 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 242 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.47 
 
 		 382 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23 
 
 		 442 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 440 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 370 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  33.63 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  36.46 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  26.63 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  34.72 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  20 
 
 		 442 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  23.73 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.53 
 
 		 378 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  23.73 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  37.98 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  34.06 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.15 
 
 		 442 aa  48.9  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  33.09 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  18.7 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  26.72 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.15 
 
 		 442 aa  48.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 366 aa  48.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 391 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  27.64 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  30.34 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  26.52 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 		 378 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.47 
 
 		 369 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.89 
 
 		 427 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  25.53 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  30.08 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  25.42 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2384  phosphoglycerate mutase family protein  25.52 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.08 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  26.49 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  27.17 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1805  Phosphoglycerate mutase  38.96 
 
 		 159 aa  46.2  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.622206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.52 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  24.03 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>