242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1721 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 179 aa  360  8e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  73.18 
 
 		 179 aa  254  4e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3495  phosphoglycerate mutase  71.51 
 
 		 201 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2243  phosphoglycerate mutase  70.39 
 
 		 200 aa  249  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580573  normal  0.494376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  46.15 
 
 		 189 aa  149  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  48.46 
 
 		 187 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  37.85 
 
 		 195 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 		 184 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  37.3 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  37.3 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  37.17 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 197 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 183 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  42.93 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  39.1 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 195 aa  98.6  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 		 196 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 196 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 196 aa  94.4  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 183 aa  91.7  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 191 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  41.59 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30.83 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29.59 
 
 		 222 aa  62  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 		 222 aa  62  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  32.64 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  37.36 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2366  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18835  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.83 
 
 		 382 aa  58.9  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  27.21 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  27.21 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  36.3 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  35.34 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 		 401 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  32.17 
 
 		 440 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.09 
 
 		 378 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  27.07 
 
 		 378 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  29.12 
 
 		 370 aa  55.1  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1654  putative phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.6 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  24.87 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  33.03 
 
 		 591 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 		 220 aa  53.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  25.67 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  28.06 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  27.27 
 
 		 378 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  24.32 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  24.32 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 227 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  28.26 
 
 		 243 aa  51.6  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  33.86 
 
 		 199 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  33.86 
 
 		 616 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  33.86 
 
 		 199 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  33.86 
 
 		 199 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  33.86 
 
 		 199 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  33.86 
 
 		 199 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  33.86 
 
 		 199 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  22.88 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 200 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 261 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 230 aa  51.2  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 209 aa  51.2  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 261 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.09 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  30.41 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  24.32 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  24.6 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  29.88 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  31.4 
 
 		 235 aa  49.3  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  28.31 
 
 		 232 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  23.47 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  28.67 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  25.93 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 		 230 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  31.08 
 
 		 234 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  34.51 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  33.33 
 
 		 188 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 391 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 242 aa  48.5  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  27.97 
 
 		 218 aa  48.5  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  26.72 
 
 		 235 aa  48.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>