218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3438 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 191 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  55.67 
 
 		 197 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  56.06 
 
 		 198 aa  175  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  51.38 
 
 		 195 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  48.95 
 
 		 196 aa  157  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  48.95 
 
 		 196 aa  157  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  49.46 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  51.12 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  46.56 
 
 		 184 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  46.49 
 
 		 184 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  51.32 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  51.12 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  47.8 
 
 		 187 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  44.97 
 
 		 189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3495  phosphoglycerate mutase  44.19 
 
 		 201 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  42.93 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  40.21 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  41.4 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  41.4 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  41.94 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2243  phosphoglycerate mutase  41.86 
 
 		 200 aa  111  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580573  normal  0.494376 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  40.48 
 
 		 179 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  41.53 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  39.31 
 
 		 370 aa  85.1  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  38.14 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.41 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.79 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.34 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  40.38 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  35.36 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  40.77 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  40.6 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  39.23 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 		 378 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.6 
 
 		 365 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.6 
 
 		 365 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.6 
 
 		 365 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.72 
 
 		 356 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.77 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2980  hypothetical protein  36.44 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2366  phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18835  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.27 
 
 		 382 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  25.27 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  32.6 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  29.03 
 
 		 383 aa  54.7  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 		 412 aa  54.3  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  27.96 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  35.04 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.6 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3632  phosphoglycerate mutase  38.93 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0727435  normal  0.884064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.46 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  26.46 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  32.06 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  22.75 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  28.95 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  26.46 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 		 402 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  35.91 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  32.86 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 		 241 aa  52.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  26.8 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  28.57 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  28.57 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  28.57 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  25.93 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  25.13 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  25.93 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  27.57 
 
 		 207 aa  51.2  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  28.16 
 
 		 202 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  30.66 
 
 		 239 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 		 241 aa  51.6  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  28.19 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  28.57 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  25.79 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  25.81 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  28.57 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  26.9 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  25.81 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  25.93 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  29.23 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>