212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4978 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 196 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  94.39 
 
 		 196 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  94.39 
 
 		 196 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  77.84 
 
 		 195 aa  292  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  73.47 
 
 		 195 aa  269  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  73.47 
 
 		 195 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  48.66 
 
 		 197 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  46.81 
 
 		 198 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  49.46 
 
 		 191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  42.55 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  37.78 
 
 		 184 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  37.37 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  37.37 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  44.02 
 
 		 191 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.14 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  37.37 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 183 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 		 179 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 237 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3495  phosphoglycerate mutase  34.32 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2243  phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580573  normal  0.494376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  37.23 
 
 		 452 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.56 
 
 		 378 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.19 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 370 aa  68.2  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  24.86 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.09 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 391 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  34.72 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  27.21 
 
 		 401 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  31.97 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  30.91 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  27.74 
 
 		 412 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3632  phosphoglycerate mutase  38.69 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0727435  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  27.38 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1654  putative phosphoglycerate mutase  39.05 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 366 aa  55.1  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1730  phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  24.1 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  33.93 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  25.95 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  24.1 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  27.07 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  27.12 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  30.17 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  27.12 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.08 
 
 		 365 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.08 
 
 		 365 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.08 
 
 		 365 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  26 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  29.07 
 
 		 241 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  23.2 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  23.2 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.86 
 
 		 369 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1834  Phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  30.08 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 235 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  24.46 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  25.47 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.46 
 
 		 382 aa  51.2  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2384  phosphoglycerate mutase family protein  28.29 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  23.4 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  23.2 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  25.41 
 
 		 272 aa  50.1  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1642  Phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  25.82 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2366  phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18835  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  25.47 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  27.82 
 
 		 383 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  20.71 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  26.99 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  24.32 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  23.6 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  32.7 
 
 		 389 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  25.47 
 
 		 203 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  25.47 
 
 		 203 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  26.96 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>