More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4650 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 195 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  95.38 
 
 		 195 aa  358  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  73.44 
 
 		 195 aa  268  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  73.47 
 
 		 196 aa  268  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  71.43 
 
 		 196 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  71.43 
 
 		 196 aa  261  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  48.13 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  46.81 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  51.12 
 
 		 191 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 		 183 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 		 183 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 		 183 aa  120  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 		 185 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  43.24 
 
 		 187 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  40.76 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  37.99 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  37.99 
 
 		 184 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.95 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  37.29 
 
 		 179 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  42.16 
 
 		 191 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  39.49 
 
 		 237 aa  94.4  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3495  phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 201 aa  87  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2243  phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580573  normal  0.494376 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.64 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  34.55 
 
 		 452 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.33 
 
 		 378 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 411 aa  75.9  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  42.02 
 
 		 440 aa  74.7  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.64 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.64 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.62 
 
 		 382 aa  68.6  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.33 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  28.31 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  33.04 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  25.67 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  25.67 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.8 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  36.81 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 366 aa  65.5  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 391 aa  64.7  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  28.11 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  29.77 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  28.37 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.26 
 
 		 427 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  29.24 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  36.91 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1805  Phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.622206  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2366  phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18835  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  35.71 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  27.71 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  29.93 
 
 		 383 aa  58.9  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  25.68 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3632  phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0727435  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  28.65 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  23.03 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  24.6 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  32.48 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  29.12 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  24.31 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  21.74 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  24.39 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  28.07 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  26.88 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  26.34 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  24.79 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.45 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  28.07 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  27.96 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.07 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2384  phosphoglycerate mutase family protein  28.38 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  28.07 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  28.07 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  27.68 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  27.54 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  28.07 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  33.8 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  26.62 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1834  Phosphoglycerate mutase  27.17 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1654  putative phosphoglycerate mutase  35.04 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>