51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1805 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1805  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 159 aa  316  7e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.622206  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  33.61 
 
 		 185 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  35.34 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  31.17 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.84 
 
 		 378 aa  58.9  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  30.52 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  30.52 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.92 
 
 		 195 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.22 
 
 		 378 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 		 195 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 179 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  36.29 
 
 		 210 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 196 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3495  phosphoglycerate mutase  40.26 
 
 		 201 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  36.11 
 
 		 196 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 196 aa  47.8  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  33.08 
 
 		 198 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 197 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  42.86 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1654  putative phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509403  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2243  phosphoglycerate mutase  38.96 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580573  normal  0.494376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  27.33 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  32.82 
 
 		 459 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 370 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  30.47 
 
 		 212 aa  44.7  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  32.04 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 		 243 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  34.75 
 
 		 440 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  30.83 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  26.89 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.91 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.28 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  29.51 
 
 		 207 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 191 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  29.51 
 
 		 207 aa  42  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  37.93 
 
 		 452 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 411 aa  41.2  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  34.57 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 378 aa  41.2  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  43.75 
 
 		 182 aa  40.8  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 402 aa  40.4  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  37.18 
 
 		 201 aa  40.4  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>