203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1874 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 179 aa  356  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3495  phosphoglycerate mutase  83.8 
 
 		 201 aa  304  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2243  phosphoglycerate mutase  83.24 
 
 		 200 aa  302  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580573  normal  0.494376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  73.18 
 
 		 179 aa  254  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  45.6 
 
 		 189 aa  144  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  48.46 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 		 183 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 		 183 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 184 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 		 185 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  38.38 
 
 		 183 aa  98.2  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  37.7 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.93 
 
 		 195 aa  92.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 195 aa  92  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 191 aa  91.3  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  41.48 
 
 		 191 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  40.56 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1654  putative phosphoglycerate mutase  37.7 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  29.68 
 
 		 401 aa  64.7  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  26.6 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  38.05 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  27.33 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  31.39 
 
 		 411 aa  58.2  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  40 
 
 		 452 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 230 aa  57.8  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 370 aa  57.8  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.05 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  35.81 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 235 aa  54.3  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 378 aa  54.3  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 234 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 		 218 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  31.51 
 
 		 366 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  34.21 
 
 		 235 aa  53.9  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  37.76 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.6 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  37.27 
 
 		 234 aa  52.4  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.53 
 
 		 378 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 		 242 aa  52  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 391 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  37.5 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.58 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 		 210 aa  50.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  22.92 
 
 		 201 aa  50.8  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  22.92 
 
 		 201 aa  50.8  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  24.7 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  24.87 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 440 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  26.34 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  24.87 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.67 
 
 		 378 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1805  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.622206  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  27.74 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  20.66 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  30.84 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  25.53 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 205 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 		 591 aa  49.3  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 222 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29.51 
 
 		 222 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  25.52 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.53 
 
 		 442 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  26.2 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  20.87 
 
 		 442 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  32.46 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.91 
 
 		 369 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  29.26 
 
 		 235 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  25.15 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  26.23 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  28.26 
 
 		 223 aa  48.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  31.2 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.53 
 
 		 442 aa  47.8  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  26.34 
 
 		 213 aa  47.8  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  27.71 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  25.98 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.05 
 
 		 365 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.05 
 
 		 365 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  31.62 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  35.61 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>