194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1433 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
183 aa  363  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  74.05 
 
 
185 aa  269  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  69.23 
 
 
183 aa  251  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  69.23 
 
 
183 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  69.23 
 
 
183 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  41.21 
 
 
184 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  47.54 
 
 
187 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 
184 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 
195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  41.15 
 
 
237 aa  128  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  40.22 
 
 
195 aa  122  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  41.3 
 
 
189 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  41.97 
 
 
198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  38.62 
 
 
197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.84 
 
 
195 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 
196 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 
196 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  38.38 
 
 
179 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 
179 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  39.89 
 
 
191 aa  101  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3495  phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 
201 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720841  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  41.53 
 
 
191 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2243  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
200 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580573  normal  0.494376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 
411 aa  71.6  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  30.53 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.89 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1805  Phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.622206  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 
235 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.11 
 
 
378 aa  67.8  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.65 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.15 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1654  putative phosphoglycerate mutase  41.9 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509403  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.04 
 
 
427 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.23 
 
 
378 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.32 
 
 
222 aa  64.3  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.32 
 
 
222 aa  64.3  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 
204 aa  62  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 
401 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 
211 aa  61.6  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  31.48 
 
 
192 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 
201 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  26.84 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 
227 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.87 
 
 
382 aa  58.5  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
366 aa  58.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  26.34 
 
 
208 aa  58.5  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 
378 aa  58.2  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.61 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  33.54 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 
241 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 
198 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 
211 aa  56.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  35.66 
 
 
195 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  37.23 
 
 
226 aa  56.6  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  28.18 
 
 
208 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  32.04 
 
 
198 aa  55.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  31.1 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 
440 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  31.49 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 
203 aa  55.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  31.49 
 
 
198 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  29.83 
 
 
191 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 
215 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  32.92 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
213 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  29.23 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  29.29 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
184 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0775  Phosphoglycerate mutase  22.75 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  38.78 
 
 
452 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 
370 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  28.65 
 
 
190 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  28.87 
 
 
202 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  23.37 
 
 
209 aa  51.6  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 
237 aa  51.6  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
203 aa  51.6  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
210 aa  51.2  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 
214 aa  51.2  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  28.87 
 
 
202 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
218 aa  51.2  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  22.58 
 
 
216 aa  51.2  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 
214 aa  51.2  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.02 
 
 
365 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3632  phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 
199 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0727435  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.02 
 
 
365 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.02 
 
 
365 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  31.54 
 
 
243 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 
391 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  28.87 
 
 
202 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>