112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3632 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3632  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 199 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0727435  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  43.01 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  42.31 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1834  Phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  41.98 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  41.22 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  40.15 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  40.15 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  35.86 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3207  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  38.69 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  27 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 412 aa  55.5  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3479  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5099  putative phosphoglycerate mutase family protein  30.81 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  37.67 
 
 		 383 aa  55.1  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2263  phosphoglycerate mutase  27.45 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.704103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  34.23 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3706  Phosphoglycerate mutase  27.86 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175906  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  37.41 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  35.17 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  33.08 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.59 
 
 		 378 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  31.32 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  33.08 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  29.32 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  36.73 
 
 		 261 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0187  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 229 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460351  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  41.51 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  27.08 
 
 		 591 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0480  phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393842  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.22 
 
 		 378 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3653  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 249 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00889427  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.33 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.86 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  36.7 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 183 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  35.06 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  36.78 
 
 		 256 aa  48.5  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  36.62 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0603  hypothetical protein  29.53 
 
 		 192 aa  48.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  29.94 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2256  phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00135316  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2980  hypothetical protein  31.35 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  35.21 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  35.09 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  35.81 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  38.94 
 
 		 402 aa  45.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 198 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  25.55 
 
 		 174 aa  44.7  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  28.8 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  26.52 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  38.93 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.36 
 
 		 369 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  38 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.71 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 245 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  28.77 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  36.19 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  28.77 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2384  phosphoglycerate mutase family protein  29.84 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  36.19 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17495  bifunctional 6-phosphofructo-2-kinase  33.33 
 
 		 540 aa  42.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 155 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 		 210 aa  42  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.86 
 
 		 356 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 249 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>