More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0603 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0603  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  380  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2256  phosphoglycerate mutase  97.92 
 
 		 192 aa  354  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00135316  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0480  phosphoglycerate mutase  78.65 
 
 		 192 aa  299  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393842  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  49.21 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2980  hypothetical protein  55.61 
 
 		 190 aa  177  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  46.03 
 
 		 190 aa  169  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 		 191 aa  97.8  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3706  Phosphoglycerate mutase  32.66 
 
 		 251 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175906  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2263  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 253 aa  91.3  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.704103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3207  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 251 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  37.3 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 212 aa  84.3  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.24 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5099  putative phosphoglycerate mutase family protein  30.65 
 
 		 235 aa  81.3  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3479  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  37.82 
 
 		 210 aa  77  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  30.48 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 402 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.61 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3653  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00889427  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  30.93 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  38.32 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.13 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  36.24 
 
 		 383 aa  72.4  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  37.42 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0187  Phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460351  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  36.31 
 
 		 194 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 		 411 aa  69.3  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.37 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.88 
 
 		 378 aa  68.6  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 412 aa  68.6  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  36.69 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.2 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.52 
 
 		 369 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1834  Phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  32.64 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  33.58 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  26.26 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  35.67 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  39.29 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  28.34 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  31.08 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  35.77 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2384  phosphoglycerate mutase family protein  29.03 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  33.33 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.81 
 
 		 378 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  30.92 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  31.77 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  33.16 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  31.76 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  34.67 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  31.55 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  34.67 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  34.67 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.26 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 253 aa  64.7  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  34.03 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  38.79 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  38.02 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  30.46 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12100  fructose-2,6-bisphosphatase  35 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0451501  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  31.19 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>