More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1834 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1834  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 221 aa  456  1e-127  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  49.26 
 
 		 226 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3479  phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 		 262 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3207  phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3706  Phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 		 251 aa  124  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.175906  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 		 191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2263  phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.704103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5099  putative phosphoglycerate mutase family protein  35.61 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0187  Phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460351  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3653  phosphoglycerate mutase  35.24 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00889427  normal  0.0152076 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.54 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 186 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  27.75 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  29.02 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  25.68 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  28.08 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  35.86 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 370 aa  68.2  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  26.86 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  30.11 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 193 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.47 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  28.37 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.84 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36168  predicted protein  31.22 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  26.04 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0480  phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393842  normal  0.153486 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  29.08 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2256  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00135316  normal  0.584402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  32.92 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  27.01 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 		 366 aa  65.9  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  30.26 
 
 		 401 aa  65.1  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  27.01 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0603  hypothetical protein  32.26 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  32.79 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0357  Phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.806672  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  28.31 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  28.49 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  27.86 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  23.76 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  27.87 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  29.6 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  27 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3632  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0727435  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  30.24 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  27.88 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  25.74 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  27.75 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  29.27 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  28.71 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  26.15 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>