207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0358 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  100 
 
 
195 aa  384  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  79.9 
 
 
196 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  79.9 
 
 
196 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  77.84 
 
 
196 aa  292  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  74.48 
 
 
195 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  73.44 
 
 
195 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  48.95 
 
 
197 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  48.69 
 
 
198 aa  154  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  51.38 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  43.26 
 
 
187 aa  120  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  37.7 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  36.17 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  39.46 
 
 
183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  39.46 
 
 
183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  38.92 
 
 
183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 
184 aa  101  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.53 
 
 
189 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 
179 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  40.31 
 
 
191 aa  98.2  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  37.84 
 
 
183 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  35.93 
 
 
179 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3495  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 
201 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720841  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2243  phosphoglycerate mutase  35.93 
 
 
200 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580573  normal  0.494376 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.25 
 
 
378 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.65 
 
 
378 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36.03 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.88 
 
 
440 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
391 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
222 aa  67.8  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  27.64 
 
 
212 aa  67.8  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 
411 aa  67.8  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  30.94 
 
 
222 aa  67.8  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.11 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  25.26 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  25.26 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 
214 aa  62.4  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  29.93 
 
 
401 aa  62.4  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  32.33 
 
 
383 aa  62.4  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1654  putative phosphoglycerate mutase  39.81 
 
 
179 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509403  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.64 
 
 
369 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 
204 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  27.62 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  27.86 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  27.86 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  25.88 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 
213 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  26.56 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  28.45 
 
 
412 aa  58.9  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2384  phosphoglycerate mutase family protein  28.4 
 
 
196 aa  58.5  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.56 
 
 
212 aa  58.2  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  24.48 
 
 
206 aa  58.2  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 
378 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1895  phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1834  Phosphoglycerate mutase  29.6 
 
 
221 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.960984  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  22.95 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  27.07 
 
 
203 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.43 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.57 
 
 
427 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.07 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  27.07 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  27.07 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  27.07 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  27.07 
 
 
203 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 
202 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 
225 aa  55.5  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  32.74 
 
 
196 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 
195 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  27.33 
 
 
230 aa  54.7  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2487  phosphoglycerate mutase  37.39 
 
 
203 aa  54.7  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.0901499 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.83 
 
 
365 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.83 
 
 
365 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  27.07 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.83 
 
 
365 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  29.8 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 
241 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 
366 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.04 
 
 
382 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  28.26 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  30.08 
 
 
226 aa  52.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  25.32 
 
 
191 aa  52.4  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1805  Phosphoglycerate mutase  32.92 
 
 
159 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.622206  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 
206 aa  52.4  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  31.32 
 
 
234 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 
195 aa  52  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  25.87 
 
 
213 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
227 aa  51.6  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  23.12 
 
 
212 aa  51.2  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 
200 aa  51.2  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  20 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 
223 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  22.69 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>