169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2060 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2060  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  100 
 
 		 189 aa  386  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1721  phosphoglycerate mutase  46.15 
 
 		 179 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.984098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  45.05 
 
 		 184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3175  Phosphoglycerate mutase  43.72 
 
 		 184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0998177  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1874  phosphoglycerate mutase  45.6 
 
 		 179 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.760492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3495  phosphoglycerate mutase  45.6 
 
 		 201 aa  141  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.720841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2243  phosphoglycerate mutase  45.3 
 
 		 200 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580573  normal  0.494376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  48.31 
 
 		 187 aa  137  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  41.53 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  41.53 
 
 		 183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  41.53 
 
 		 183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  39.34 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3438  phosphoglycerate mutase  44.92 
 
 		 191 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  39.29 
 
 		 195 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4650  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 195 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  41.3 
 
 		 183 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2602  putative phosphoglycerate mutase  34.05 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3077  phosphoglycerate mutase  37.71 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5290  phosphoglycerate mutase  37.71 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4978  phosphoglycerate mutase  37.14 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0358  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.53 
 
 		 195 aa  98.6  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125683  normal  0.913627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 191 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6613  Phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.253951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 237 aa  95.5  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 191 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.63 
 
 		 378 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  42.5 
 
 		 452 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.85 
 
 		 378 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  37.78 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  37.78 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1654  putative phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.509403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.4 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  29.77 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  33.03 
 
 		 378 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 391 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.18 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.57 
 
 		 382 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  41.43 
 
 		 440 aa  55.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  36.25 
 
 		 411 aa  54.7  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  24.62 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  24.49 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  31.82 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  29.46 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  30.52 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  42.86 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.78 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  22.84 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  22.84 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  29.91 
 
 		 438 aa  52.4  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  27.97 
 
 		 389 aa  51.6  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  33.64 
 
 		 215 aa  51.6  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  30.18 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.46 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 412 aa  51.2  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1109  phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.782275  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  29.93 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1805  Phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 159 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.622206  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  28.47 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  30.83 
 
 		 366 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  26.34 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2366  phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18835  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  28.07 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  38.2 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  28.1 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  22.36 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.03 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  31.39 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  27.45 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  27.43 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  28.76 
 
 		 182 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  28.03 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 		 401 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  31.2 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 		 220 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  26.32 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  24.12 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2980  hypothetical protein  35.51 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.68 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  25.93 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  27.13 
 
 		 383 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  26.43 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>