More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1109 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1109  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 210 aa  437  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.782275  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1824  Phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.87879e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21080  fructose-2,6-bisphosphatase  34.27 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2205  Phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 217 aa  94.7  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1293  phosphoglycerate mutase family protein  34.67 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1112  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  34.17 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.855452  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.05 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.05 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  26.57 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  28.68 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  31.44 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  26.82 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  25 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  24.06 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  32.21 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  26.18 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  25.84 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 		 233 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  27.21 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2165  phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00557331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0540  phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.803779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  25.81 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  31.62 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  27.94 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.15 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  26.34 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  23.92 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  29.93 
 
 		 389 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  24.64 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 449 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  27.87 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  23.92 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  27.01 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  27.15 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  28.68 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  27.47 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  31.01 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16010  fructose-2,6-bisphosphatase  27.69 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  28.25 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0251  phosphoglycerate mutase family protein  27.57 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1416  Phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  27.05 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  25.13 
 
 		 452 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.86 
 
 		 442 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  26.9 
 
 		 356 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0974  phosphoglycerate mutase  26.9 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  27.34 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  26.06 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  27.21 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  24.86 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  26.55 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.43 
 
 		 442 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  26.11 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  26.56 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  27.41 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  24.83 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  29.69 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1016  Phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  28.08 
 
 		 383 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  26.92 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  27.12 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  26.9 
 
 		 412 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 		 378 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  23.76 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  28.03 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  29.69 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  29.69 
 
 		 203 aa  52  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7078  phosphoglycerate mutase  26.01 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0775  Phosphoglycerate mutase  24.76 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 391 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.69 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  28.25 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  29.69 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 447 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 		 228 aa  51.6  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  29.69 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  25.42 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  27.56 
 
 		 213 aa  51.6  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>