More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0974 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0974  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1008  phosphoglycerate mutase  95.88 
 
 		 243 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  95.06 
 
 		 239 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  93.42 
 
 		 239 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  84.02 
 
 		 241 aa  407  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3281  phosphoglycerate mutase  64.52 
 
 		 240 aa  328  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0839  phosphoglycerate mutase  66.13 
 
 		 240 aa  316  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3183  phosphoglycerate mutase  65.32 
 
 		 240 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1031  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  57.69 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  39.58 
 
 		 204 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  40.93 
 
 		 203 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  40.95 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  39.83 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  35.62 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 190 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  36.36 
 
 		 190 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 		 207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  34.26 
 
 		 206 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  33.64 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 		 209 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  36.87 
 
 		 188 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35 
 
 		 191 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  34.85 
 
 		 188 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 217 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  35.86 
 
 		 188 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  32.83 
 
 		 189 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  34.5 
 
 		 194 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  30.26 
 
 		 204 aa  92.8  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  35.56 
 
 		 193 aa  91.7  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  33.5 
 
 		 194 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.53 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  31.48 
 
 		 196 aa  90.1  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  34 
 
 		 189 aa  89  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.19 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  26.38 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.24 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  27.07 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  31.42 
 
 		 190 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.16 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  30.69 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.34 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  34.2 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  28.5 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  27.07 
 
 		 213 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  26.91 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  25.76 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 		 202 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  26.01 
 
 		 200 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  28.38 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  25.75 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  28.27 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  27.31 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.56 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  27.93 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  27.69 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.43 
 
 		 382 aa  62  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  27.03 
 
 		 203 aa  62  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  25.56 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  25.56 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  31.64 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  32.21 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1824  Phosphoglycerate mutase  25.47 
 
 		 194 aa  61.6  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.87879e-20  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.03 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  25.56 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  27.03 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  27.03 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  27.03 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  27.03 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  27.03 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  27.55 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  32.41 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  27.21 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  30.22 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  27.51 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  25.51 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  27.66 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  30.22 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0462  Phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000310239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  30.22 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.73 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  30.22 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  24.15 
 
 		 370 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  24.68 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  27.14 
 
 		 378 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  28.08 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  26.61 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  24.84 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>