More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21080 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_21080  fructose-2,6-bisphosphatase  100 
 
 
197 aa  406  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1109  phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.782275  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 
210 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1824  Phosphoglycerate mutase  28.82 
 
 
194 aa  98.6  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.87879e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2205  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
217 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1293  phosphoglycerate mutase family protein  27.92 
 
 
214 aa  86.3  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1112  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.92 
 
 
214 aa  85.5  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.855452  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  31.84 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1627  phosphoglycerate mutase  32.62 
 
 
217 aa  68.6  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2366  phosphoglycerate mutase  39.26 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18835  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  33.74 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0941  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
265 aa  64.3  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  31.78 
 
 
216 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 
215 aa  62.8  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  35.22 
 
 
205 aa  62.8  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0775  Phosphoglycerate mutase  26.15 
 
 
190 aa  62  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3194  phosphoglycerate mutase  28.09 
 
 
237 aa  62  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0874963  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  30.49 
 
 
216 aa  62  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  27.78 
 
 
197 aa  61.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0357  Phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.806672  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 
214 aa  60.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0251  phosphoglycerate mutase family protein  27.69 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3287  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
234 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3257  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
234 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3203  phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 
234 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3545  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
234 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  29.77 
 
 
216 aa  59.7  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
191 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 
240 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3502  putative phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
234 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3497  phosphoglycerate mutase, putative  27.93 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0029752  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1765  putative phosphoglycerate mutase  27.07 
 
 
236 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0485881  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  24.16 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.81 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
215 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
215 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 
215 aa  59.3  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00810  conserved hypothetical protein  34.81 
 
 
234 aa  58.9  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
215 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  29.63 
 
 
215 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  29.81 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  29.81 
 
 
203 aa  59.3  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
215 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
215 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
215 aa  58.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
215 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.57 
 
 
196 aa  59.3  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
215 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3484  putative phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 
236 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0435  phosphoglycerate mutase  24.23 
 
 
193 aa  58.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0424  phosphoglycerate mutase  24.23 
 
 
193 aa  58.5  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.845746  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  32.21 
 
 
194 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 
216 aa  58.2  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  26.35 
 
 
207 aa  58.2  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  29.19 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 
226 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3513  putative phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  26.35 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  30.43 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  33.12 
 
 
227 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  29.19 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 
209 aa  57  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  29.09 
 
 
216 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  29.19 
 
 
203 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  28.02 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6284  Phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.109151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  29.41 
 
 
438 aa  56.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  29.19 
 
 
203 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 
194 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 
198 aa  55.8  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  29.19 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3047  phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 
260 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1293  phosphoglycerate mutase family protein  24.86 
 
 
221 aa  55.8  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  36.51 
 
 
189 aa  55.8  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 
230 aa  55.5  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  32.92 
 
 
207 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  33.08 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  33.08 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  33.08 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  33.08 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 
206 aa  55.5  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  33.08 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 
209 aa  55.1  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 
229 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  29.87 
 
 
181 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  37.74 
 
 
218 aa  55.1  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 
200 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  26.9 
 
 
209 aa  55.1  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  28.09 
 
 
200 aa  54.7  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1904  phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 
197 aa  54.7  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 
225 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  25.91 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>