More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0775 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0775  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
190 aa  380  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2384  phosphoglycerate mutase family protein  35.36 
 
 
196 aa  98.6  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
203 aa  92  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.9 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.9 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.9 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  30.15 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 
217 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 
211 aa  82  0.000000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  34.78 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  28.65 
 
 
222 aa  75.5  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  32.4 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  27.46 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  28.93 
 
 
214 aa  71.6  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 
216 aa  71.2  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  26.74 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 
209 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  26.46 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0052  phosphoglycerate mutase family protein  32.56 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  26.74 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  28.5 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  27.51 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  28.73 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  31.14 
 
 
199 aa  68.2  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  30.52 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 
209 aa  67.8  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.12 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  26.52 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  29.3 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  26.52 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  28.06 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  27.45 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  26.23 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1824  Phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.87879e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0424  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.845746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0435  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 
204 aa  64.3  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  28.57 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 
207 aa  64.3  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  23.73 
 
 
208 aa  64.3  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 
213 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 
209 aa  62.8  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  27.32 
 
 
179 aa  62.4  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 
216 aa  62.4  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 
221 aa  62.4  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 
217 aa  62.4  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.21 
 
 
196 aa  62  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.29 
 
 
442 aa  62  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21080  fructose-2,6-bisphosphatase  26.15 
 
 
197 aa  62  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 
225 aa  62  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
233 aa  62  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
192 aa  61.6  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  27 
 
 
223 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2379  phosphoglycerate mutase  23.56 
 
 
203 aa  61.6  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.60758  hitchhiker  0.00228115 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.77 
 
 
442 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  24.21 
 
 
193 aa  61.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 
198 aa  61.2  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 
203 aa  61.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  32.05 
 
 
218 aa  60.5  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  28.95 
 
 
208 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5172  Phosphoglycerate mutase  25.26 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.23568  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  31.17 
 
 
210 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  28.32 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 
216 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  31.06 
 
 
202 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  28.49 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  24.23 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  30.13 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  28.79 
 
 
211 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  30.2 
 
 
202 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 
220 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  28.14 
 
 
212 aa  59.3  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 
200 aa  58.9  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 
177 aa  58.9  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>