More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2203 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  100 
 
 		 192 aa  383  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  91.67 
 
 		 192 aa  357  4e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  76.56 
 
 		 192 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  51.53 
 
 		 196 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  43.09 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  43.09 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  43.09 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  43.09 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  43.09 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  43.09 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  43.65 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  43.75 
 
 		 616 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  44.09 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  44.09 
 
 		 194 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  44.09 
 
 		 194 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  38.27 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  40.23 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  45.93 
 
 		 194 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 177 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 		 191 aa  104  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  37.93 
 
 		 196 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  43.18 
 
 		 195 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  40.68 
 
 		 196 aa  101  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.24 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  44.2 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  33.69 
 
 		 197 aa  98.2  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  43.6 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  38.42 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  42.58 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  37.21 
 
 		 183 aa  87.8  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  38.75 
 
 		 203 aa  87  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 181 aa  87  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  32.21 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 204 aa  84.7  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  32.78 
 
 		 177 aa  84  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  39.38 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  29.87 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  37.67 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.26 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.74 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.74 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  31.02 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  29.55 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  29.71 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  37.19 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  35.42 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  26.74 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  23.94 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2384  phosphoglycerate mutase family protein  24.34 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  26.2 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  36.44 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  28.75 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  26.82 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  40.71 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  36.25 
 
 		 363 aa  58.2  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  32.59 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  31.95 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3243  phosphoglycerate mutase  39.39 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.369324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  23.35 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  27.69 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  31.52 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  40.98 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0695  phosphoglycerate mutase family protein  30.37 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.597978  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  41.77 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>