100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2301 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  100 
 
 		 199 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  58.62 
 
 		 183 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  53.33 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  38.58 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  37.71 
 
 		 183 aa  127  9.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  40.46 
 
 		 194 aa  92  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  33.84 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  38.25 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.07 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 174 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  37.01 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  41.03 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  35.42 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  40.98 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  37.84 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  29.45 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  39.6 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  39.6 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  39.6 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  39.6 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  39.6 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.52 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 		 177 aa  62  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  39.6 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  38.52 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  34.35 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  39.35 
 
 		 616 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  30.56 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  38.89 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  30.9 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.06 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  35.4 
 
 		 177 aa  54.3  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.19 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5886  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  36.61 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  32.9 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  27.91 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  29.05 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  40.27 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  30.61 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  41.61 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  39.19 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  39.19 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0724  Phosphoglycerate mutase  25.14 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0153538  normal  0.0816175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 		 177 aa  48.5  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 191 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  32.19 
 
 		 183 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  32.19 
 
 		 183 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  37.25 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 411 aa  47.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  36.3 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 402 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  28.18 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  31.51 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  45.76 
 
 		 183 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 190 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  37.06 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  37.76 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 		 242 aa  45.1  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  36.19 
 
 		 185 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  30.87 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  34.51 
 
 		 218 aa  44.7  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  37.06 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  35.92 
 
 		 370 aa  45.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  34.94 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  27.27 
 
 		 204 aa  44.7  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  40.45 
 
 		 452 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  28.66 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  41.25 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.82 
 
 		 378 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5099  putative phosphoglycerate mutase family protein  31.67 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  41.25 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  41.25 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  35.35 
 
 		 401 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2205  Phosphoglycerate mutase  28.08 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 		 251 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  29.75 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  34 
 
 		 378 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  23.31 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  27.13 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  34.17 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  25.44 
 
 		 196 aa  41.2  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>