More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2026 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 177 aa  367  1e-101  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  44.63 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  35.36 
 
 		 177 aa  98.6  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  36.46 
 
 		 177 aa  90.9  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 174 aa  90.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  35.4 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  36.08 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.65 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  32.48 
 
 		 200 aa  74.3  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.26 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  30.63 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  34.32 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 182 aa  70.9  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  29.34 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0110  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.61 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0908349  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  27.74 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2384  phosphoglycerate mutase family protein  30.69 
 
 		 196 aa  67  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  29.24 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1462  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  28.12 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  28.3 
 
 		 225 aa  64.3  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  28.75 
 
 		 192 aa  64.3  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  30.18 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  30.97 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.22 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  31.41 
 
 		 180 aa  62  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  31.85 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4156  phosphoglycerate mutase  26.57 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 		 234 aa  61.2  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 217 aa  60.8  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.24 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  28.42 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.68 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  34.76 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  27.12 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  27.87 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  34.88 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  30.77 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  28.19 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 224 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  30.13 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  30.65 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  28.03 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  30.65 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  26.97 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  33.14 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  30.65 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  30.65 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  30.65 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  30.65 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  26.28 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  31.08 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  25.31 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  30.67 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  26.99 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.22 
 
 		 442 aa  55.1  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  32.33 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  28.38 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  26.99 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  26.99 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  25.99 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>