More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0632 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 177 aa  367  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  38.67 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.6 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  35.23 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.36 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  34.25 
 
 		 196 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  32.58 
 
 		 177 aa  95.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 203 aa  91.3  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  36.88 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 192 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  35.2 
 
 		 199 aa  88.2  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  35.2 
 
 		 199 aa  88.2  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  35.2 
 
 		 199 aa  88.2  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  35.2 
 
 		 199 aa  88.2  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  35.2 
 
 		 199 aa  88.2  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  35.2 
 
 		 199 aa  88.2  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 202 aa  88.2  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 194 aa  87  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  35.2 
 
 		 616 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  31.07 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 196 aa  85.1  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 		 203 aa  85.1  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  32.95 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 		 200 aa  84.7  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  36.46 
 
 		 177 aa  84.3  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  33.15 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  36.87 
 
 		 194 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  31.03 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  35.75 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29.89 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  32.96 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 196 aa  74.3  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 402 aa  71.6  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 		 197 aa  70.9  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  29.05 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  34.64 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.12 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 		 412 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  31.3 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  32.12 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  26.67 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 		 370 aa  62.4  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.06 
 
 		 201 aa  62  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.25 
 
 		 214 aa  62  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 206 aa  62  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 195 aa  62  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  28.41 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  30.53 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  29.87 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  29.71 
 
 		 223 aa  60.8  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  27.96 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  29.09 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  32.33 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  29.93 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  30.53 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  25.99 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  29.49 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  27.96 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  30.53 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  26.97 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  31.41 
 
 		 200 aa  57.4  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.62 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  30.06 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  27.47 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0775  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  28.11 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  27.48 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2205  Phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  29.89 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>