136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2609 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 181 aa  364  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  58.01 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  57.78 
 
 		 182 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  47.75 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  47.51 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  49.14 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  45.65 
 
 		 200 aa  153  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  44.75 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  44.52 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  40.54 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 		 191 aa  97.1  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  34.78 
 
 		 192 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  35.87 
 
 		 192 aa  92  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 177 aa  91.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  41.03 
 
 		 196 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  39.39 
 
 		 196 aa  84.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  40 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  40 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  40 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  40 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  40 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  40 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  32.69 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  40 
 
 		 616 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.65 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  34.48 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  36.94 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  38.71 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  31.87 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  38.99 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  40.25 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  40.25 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  39.88 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  31.93 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  39.87 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  24.2 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  38.06 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  41.35 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  35.06 
 
 		 198 aa  57  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  33.04 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  32.8 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 198 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 195 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.65 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 181 aa  50.8  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0904  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  32.4 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  31.08 
 
 		 402 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  34.55 
 
 		 188 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  30.82 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  35.34 
 
 		 247 aa  48.9  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  26.83 
 
 		 215 aa  48.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 188 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.78 
 
 		 213 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.49 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.92 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.92 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  31.61 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  32.73 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  34 
 
 		 412 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  27.39 
 
 		 200 aa  45.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  31.54 
 
 		 212 aa  45.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 232 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  34.78 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5099  putative phosphoglycerate mutase family protein  28.74 
 
 		 235 aa  45.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1697  alpha-ribazole phosphatase  28.3 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  34.57 
 
 		 189 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  31.13 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  26.83 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0454  phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.079929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.48 
 
 		 442 aa  44.7  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  25.93 
 
 		 188 aa  44.7  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 201 aa  44.3  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  29.51 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  27.52 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  26.22 
 
 		 228 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  34.48 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>