253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2456 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  100 
 
 		 194 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  97.94 
 
 		 194 aa  356  9e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  97.94 
 
 		 194 aa  356  9e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  81.96 
 
 		 194 aa  297  5e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  89.12 
 
 		 194 aa  295  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  81.96 
 
 		 194 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  71.5 
 
 		 195 aa  261  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  55.56 
 
 		 616 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  55.56 
 
 		 199 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  55.56 
 
 		 199 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  55.56 
 
 		 199 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  55.56 
 
 		 199 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  55.56 
 
 		 199 aa  197  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  55.56 
 
 		 199 aa  197  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  52.04 
 
 		 196 aa  188  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  51.02 
 
 		 196 aa  187  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  56.35 
 
 		 196 aa  184  7e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  50 
 
 		 196 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  44.09 
 
 		 192 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  44.32 
 
 		 192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  41.4 
 
 		 192 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  41.42 
 
 		 195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 191 aa  111  7.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  40 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  37.5 
 
 		 179 aa  106  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  45.86 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  31.46 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 177 aa  98.6  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  35.56 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  44.81 
 
 		 182 aa  94.7  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  40.65 
 
 		 183 aa  91.7  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  42.95 
 
 		 184 aa  92  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  35.93 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  40.79 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  34.08 
 
 		 174 aa  87.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  38.07 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  45.33 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.27 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.27 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  37.01 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.66 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  37.14 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  37.42 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0724  Phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0153538  normal  0.0816175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  32.62 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  32.35 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.48 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.56 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3134  putative Alpha-ribazole phosphatase (anaerobic pathway of cobalamin biosynthesis, cobC)  37.43 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  26.8 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  30.73 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  30.32 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  30.17 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  30.77 
 
 		 222 aa  62  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  30.17 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  30.17 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  32.52 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  25.97 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.56 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  35.23 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  36.51 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  29.05 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  29.27 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.3 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  26.67 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  40.27 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.86 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 		 215 aa  57.8  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  26.56 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  29.32 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  29.61 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  29.82 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  30.93 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  31.96 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  30.99 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  30.08 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  36.73 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  29.25 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  29.48 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  25.53 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  38.14 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  30.71 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>