193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0640 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  70.72 
 
 		 182 aa  256  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  58.01 
 
 		 181 aa  184  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  49.72 
 
 		 183 aa  176  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  48.94 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  49.73 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  49.72 
 
 		 194 aa  161  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  48.13 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  44.3 
 
 		 185 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 		 177 aa  96.3  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  38.07 
 
 		 196 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  37.93 
 
 		 192 aa  88.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  39.33 
 
 		 192 aa  88.6  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.74 
 
 		 196 aa  87.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  40.13 
 
 		 196 aa  87.4  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  38.64 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  39.43 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  39.43 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  39.43 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  39.43 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  39.43 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  39.43 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  39.43 
 
 		 616 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 195 aa  85.5  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.66 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 174 aa  83.6  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  40.13 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  41.67 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  40.38 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  38.25 
 
 		 199 aa  75.5  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  39.66 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  36.75 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  39.08 
 
 		 194 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  38.96 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  33.33 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  32.89 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  34.97 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  30.82 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.97 
 
 		 194 aa  62  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  35.85 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  37.17 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0669  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.299745  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.47 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.7 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  37.61 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  30.18 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  33.54 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  29.24 
 
 		 228 aa  57  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  32.32 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.71 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  36.11 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  34.15 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.15 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  35.04 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  28.29 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  35.04 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  32.9 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  32.9 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  32.9 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  32.93 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  33.64 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  32.9 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  32.34 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  32.9 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5354  phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.72 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  30.49 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2505  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0529563 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4753  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.26299  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  20.9 
 
 		 209 aa  51.6  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4839  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 183 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 203 aa  51.6  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  36.08 
 
 		 402 aa  51.6  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  31.68 
 
 		 177 aa  51.6  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  32.1 
 
 		 202 aa  51.2  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  33.94 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  35.45 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5139  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  33.08 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  31.36 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 230 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>