240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2367 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  100 
 
 		 194 aa  374  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  93.81 
 
 		 194 aa  329  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  81.96 
 
 		 194 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  82.47 
 
 		 194 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  82.47 
 
 		 194 aa  298  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  82.38 
 
 		 194 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  72.02 
 
 		 195 aa  260  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  56.57 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  56.57 
 
 		 616 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  56.57 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  56.57 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  56.57 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  56.57 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  56.57 
 
 		 199 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  56.35 
 
 		 196 aa  181  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  52.55 
 
 		 196 aa  181  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  47.96 
 
 		 196 aa  174  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  48.47 
 
 		 196 aa  174  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  43.35 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  42.44 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  43.6 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  44.12 
 
 		 195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  38.04 
 
 		 179 aa  111  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 		 191 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  43.93 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  30.98 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  43.59 
 
 		 185 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 		 197 aa  90.5  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  43.14 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  39.74 
 
 		 183 aa  90.1  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  43.75 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 		 174 aa  88.6  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  34.64 
 
 		 177 aa  88.2  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  32.6 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  40.65 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  43.79 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  38.76 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  37.84 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.12 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.12 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.52 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  30.12 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  31.52 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  35.46 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  34.78 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  29.56 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  35.33 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  34.59 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.25 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0873  phosphoglycerate mutase  28.44 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  32.35 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.61 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  36.88 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.71 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  31.3 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  30.49 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.33 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  32.76 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  32.18 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  26.26 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  32.66 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  27.04 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  30.73 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  34.21 
 
 		 378 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  22.49 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  31.21 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  30.28 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  29.93 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  28.07 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.59 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  33.09 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  29.87 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  27.49 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  29.82 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  34.55 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>