More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1000 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  100 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  92.86 
 
 		 196 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  66.84 
 
 		 196 aa  267  8.999999999999999e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  52.04 
 
 		 194 aa  175  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  52.04 
 
 		 194 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  52.04 
 
 		 194 aa  174  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  52.04 
 
 		 194 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  50.77 
 
 		 195 aa  167  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  51.26 
 
 		 196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  47.5 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  47.5 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  47.5 
 
 		 616 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  47.5 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  47.5 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  47.5 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  47.5 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  48.47 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  48.72 
 
 		 194 aa  144  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  37.76 
 
 		 192 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  41.62 
 
 		 192 aa  117  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  38.33 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  38.27 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  33.89 
 
 		 177 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 		 177 aa  101  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.95 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  32.96 
 
 		 174 aa  97.8  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.63 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 		 177 aa  95.5  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  38.56 
 
 		 202 aa  94.4  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  37.43 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  33.51 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 197 aa  87.8  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  37.29 
 
 		 194 aa  88.2  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  40.13 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  37.82 
 
 		 200 aa  85.1  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 		 182 aa  80.1  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  38.31 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  39.1 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  37.18 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.14 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.63 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.63 
 
 		 200 aa  71.2  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  35.34 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  34.32 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  26.09 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.61 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  30.5 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 		 370 aa  65.9  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  29.24 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  30.83 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0110  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  24.86 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0908349  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  27.06 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  32.17 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  25.27 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  30.14 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  28.89 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  30.77 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  32.95 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0521  fructose-2,6-biphosphatase  30.41 
 
 		 183 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.37319  normal  0.0108392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  32.03 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  30.54 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  27.33 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  25.52 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  26.26 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  26.51 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  31.36 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0433  phosphoglycerate mutase  28.06 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  34.16 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.34 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  28.41 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  31.97 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  25.26 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  23.49 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  30.49 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1824  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.87879e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  31.1 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  23.96 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>