More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2395 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2395  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  380  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2203  alpha-ribazole phosphatase  76.56 
 
 		 192 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0925085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2661  alpha-ribazole phosphatase  74.48 
 
 		 192 aa  300  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.321223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2783  phosphoglycerate mutase  46.88 
 
 		 195 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.448968  normal  0.574141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0660  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  48.98 
 
 		 196 aa  168  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0690  phosphoglycerate mutase family protein  43.09 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1033  alpha-ribazole phosphatase  43.09 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.341718  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1193  phosphoglycerate mutase family protein  43.75 
 
 		 616 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.670037  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2964  phosphoglycerate mutase family protein  43.09 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1039  alpha-ribazole phosphatase  43.09 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.634348  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1634  alpha-ribazole phosphatase  43.09 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135976  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2322  phosphoglycerate mutase family protein  43.09 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0938513  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0839  phosphoglycerate mutase family protein, putative  42.64 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.543457  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1000  alpha-ribazole phosphatase  41.62 
 
 		 196 aa  117  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3497  putative phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.88 
 
 		 196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.668358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2456  alpha-ribazole phosphatase  44.32 
 
 		 194 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.788863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1840  phosphoglycerate mutase  43.78 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0552863  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2451  phosphoglycerate mutase  43.78 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20579  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0151  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.53 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4486  Phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2499  phosphoglycerate mutase  44.19 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458709  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0843  alpha-ribazole phosphatase  44.32 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  40.91 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0090  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 177 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  34.43 
 
 		 191 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5782  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  43.09 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1411  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 197 aa  97.8  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.722686  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2367  alpha-ribazole phosphatase  42.44 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3764  Phosphoglycerate mutase  39.77 
 
 		 196 aa  95.5  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2568  Phosphoglycerate mutase  40.35 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.691388  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0677  phosphoglycerate mutase  42.14 
 
 		 203 aa  93.2  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0384229  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5687  phosphoglycerate mutase  38.33 
 
 		 200 aa  92.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00492509  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2609  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 181 aa  89  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0640  phosphoglycerate mutase  39.33 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0203907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0656  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 203 aa  87.8  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0927  phosphoglycerate mutase  40.12 
 
 		 194 aa  87.8  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0214676  normal  0.879508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0632  phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 		 177 aa  85.9  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.209628  normal  0.482177 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0739  phosphoglycerate mutase  37.71 
 
 		 182 aa  84.7  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0704  phosphoglycerate mutase family protein  31.54 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000429574 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0845  phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249912 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1028  phosphoglycerate mutase  30.52 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  34.1 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  39.04 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  33.14 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 211 aa  72  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  29.14 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  28.93 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2026  phosphoglycerate mutase family protein  30.63 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0128823 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.7 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.7 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.52 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  26.94 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.94 
 
 		 382 aa  65.5  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  26.77 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  24.23 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  37.42 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  27.69 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2658  phosphoglycerate mutase  32.96 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  33.73 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  24.55 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  31.01 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2516  phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  25 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  31.39 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  25.65 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5179  phosphoglycerate mutase  35.25 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.341682 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  29.59 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  30.59 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  27.45 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1433  phosphoglycerate mutase  31.97 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781386  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  29.48 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  44.44 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  31.52 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  31.87 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2301  fructose-2,6-biphosphatase  37.84 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2384  phosphoglycerate mutase family protein  26.32 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3466  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.572735 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  28.25 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>