More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0462 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0462  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 192 aa  380  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000310239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3134  putative Alpha-ribazole phosphatase (anaerobic pathway of cobalamin biosynthesis, cobC)  41.92 
 
 		 197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1680  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  35.8 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  35.29 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  35.64 
 
 		 190 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3673  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36 
 
 		 190 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0299984  normal  0.0692383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1649  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 191 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  hitchhiker  0.00512316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  36.72 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1279  alpha-ribazole phosphatase  36.16 
 
 		 188 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.684394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  34.12 
 
 		 194 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  36.13 
 
 		 206 aa  90.9  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2711  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  40.62 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.319958  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 215 aa  87  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1758  phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 		 190 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0909512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  32.95 
 
 		 189 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0327  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.06 
 
 		 189 aa  85.1  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  33.77 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0703  Fis family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123579  normal  0.22759 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  33.78 
 
 		 198 aa  80.9  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  41.74 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33040  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase protein  34.27 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.011687  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  31.11 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.61 
 
 		 382 aa  77.8  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.41 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1249  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  27.17 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.29402  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1453  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  42.45 
 
 		 452 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  27.27 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  37.39 
 
 		 261 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0188  Phosphoglycerate mutase  37.39 
 
 		 261 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  0.721859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  28.33 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  30.68 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  28.33 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  27.42 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  26.32 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2044  phosphatase PhoE  26.8 
 
 		 160 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  28.47 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  27.42 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  26.8 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01925  alpha-ribazole-5''''-phosphate phosphatase  30.59 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.920687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  35.65 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  31.64 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  30.71 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  31.64 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  31.07 
 
 		 203 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  26.14 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  31.07 
 
 		 203 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2205  Phosphoglycerate mutase  28.19 
 
 		 217 aa  67  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  28.26 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0759  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  32.65 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.07 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  31.07 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  31.07 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  31.07 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.37 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0974  phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2208  alpha-ribazole phosphatase  32.33 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0271379  normal  0.94187 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.82 
 
 		 365 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.82 
 
 		 365 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.92 
 
 		 378 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.82 
 
 		 365 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  37.39 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  31.17 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.01 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.66 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0100  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0996  Phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2964  phosphoglycerate mutase  27.8 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003690  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase  37.17 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.06 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3367  phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0423  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  33.1 
 
 		 233 aa  62  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1343  Phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.390919  normal  0.275943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.94 
 
 		 427 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5377  Phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 177 aa  61.6  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  32.06 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3281  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0639  Phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  32.21 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  26.24 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>