More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1025 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1025  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 278 aa  572  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000345581  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2546  Phosphoglycerate mutase  40.17 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3047  phosphoglycerate mutase  38.75 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0941  Phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1765  putative phosphoglycerate mutase  32.92 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0485881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3194  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0874963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3497  phosphoglycerate mutase, putative  31.93 
 
 		 236 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0029752  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3484  putative phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3203  phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 		 234 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3513  putative phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 		 234 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3257  phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0842083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3502  putative phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 		 234 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3287  phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 		 234 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3545  phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 		 234 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3466  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0311  Phosphoglycerate mutase  31.3 
 
 		 235 aa  92.8  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0158  fructose-2,6-bisphosphatase  29.27 
 
 		 234 aa  92.4  7e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000695658  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1022  phosphoglycerate mutase  29.96 
 
 		 231 aa  89.7  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 		 216 aa  89.7  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0092  phosphoglycerate mutase family protein  29.55 
 
 		 230 aa  85.9  7e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0665  Phosphoglycerate mutase  27.85 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0392095  hitchhiker  0.00083229 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1627  phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1293  phosphoglycerate mutase family protein  26.61 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1692  phosphoglycerate mutase family protein  30.15 
 
 		 216 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.730655  hitchhiker  5.23807e-16 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0327  phosphoglycerate mutase family protein  30.77 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000103496  hitchhiker  7.17223e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1837  phosphoglycerate mutase  30.33 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0382  phosphoglycerate mutase family protein  27.57 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000714196  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0371  phosphoglycerate mutase family protein  28 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1441  phosphoglycerate mutase family protein  29.8 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0239  phosphoglycerate mutase  27.85 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0251  phosphoglycerate mutase family protein  30.41 
 
 		 223 aa  68.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  34.75 
 
 		 192 aa  67  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0424  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 193 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.845746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0435  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 193 aa  67  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0619  phosphoglycerate mutase family protein  28.12 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  39.62 
 
 		 207 aa  66.2  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  38.38 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  29.5 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  27.36 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  40.57 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  26.22 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  31.55 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  27.69 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  38.14 
 
 		 195 aa  62  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  26.04 
 
 		 216 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  26.5 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  38.68 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  27.69 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  27.69 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  25.26 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  27.69 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  26.82 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1051  Phosphoglycerate mutase  27.31 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  27.84 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  27.95 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  35.4 
 
 		 447 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  33.88 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  29.93 
 
 		 448 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  28.35 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  25.69 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  34.11 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  28.35 
 
 		 203 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 		 203 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  36.54 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  33.02 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  25.26 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  38.3 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  26.89 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.62 
 
 		 547 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  38.3 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  38.3 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  36.67 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  40 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  27.84 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  28.27 
 
 		 205 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  26.2 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  25.88 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  37.63 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  26.04 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  27.84 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  29.93 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  38.89 
 
 		 442 aa  55.8  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  25.62 
 
 		 459 aa  55.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  25.81 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  41.49 
 
 		 227 aa  55.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 214 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  34.44 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  27.14 
 
 		 203 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>