More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8239 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8239  putative phosphoglycerate mutase  100 
 
 
194 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  51.28 
 
 
199 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  49.24 
 
 
208 aa  128  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  38.1 
 
 
213 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  43.51 
 
 
192 aa  106  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  41.52 
 
 
214 aa  104  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 
212 aa  101  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4079  Phosphoglycerate mutase  49.15 
 
 
215 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0325691  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  40.24 
 
 
205 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  36.95 
 
 
200 aa  97.8  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  39.68 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 
447 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  36.61 
 
 
389 aa  96.3  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  39.2 
 
 
214 aa  95.9  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  39.2 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  42.13 
 
 
378 aa  95.1  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 
214 aa  93.6  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  39.29 
 
 
214 aa  94  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  39.53 
 
 
210 aa  93.6  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
209 aa  94  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 
208 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  41.51 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  39.08 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  39.08 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 
212 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  38.33 
 
 
222 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  38.33 
 
 
222 aa  93.2  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 
215 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  39.08 
 
 
215 aa  93.2  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 
220 aa  92.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 
448 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  37.28 
 
 
202 aa  90.9  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  40.96 
 
 
228 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  40.99 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 
215 aa  90.9  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.78 
 
 
378 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  39.38 
 
 
211 aa  89.7  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 
214 aa  89.7  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 
235 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 
218 aa  89  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  36.08 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 
217 aa  88.6  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
212 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  37.72 
 
 
227 aa  88.2  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
448 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 
459 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  35.88 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  37.76 
 
 
205 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 
215 aa  87.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  41.32 
 
 
243 aa  86.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  37.16 
 
 
253 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.98 
 
 
200 aa  85.9  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.98 
 
 
200 aa  85.9  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.66 
 
 
200 aa  85.9  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.78 
 
 
378 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  31.91 
 
 
438 aa  85.9  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 
237 aa  85.5  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  41.21 
 
 
234 aa  84  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.75 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.79 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.94 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.05 
 
 
442 aa  83.2  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.59 
 
 
443 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  39.1 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
214 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  33.94 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  37.79 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  37.79 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 
213 aa  82  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  36.93 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.88 
 
 
369 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.21 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.36 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  38.22 
 
 
193 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  38.75 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0651  phosphoglycerate mutase  41.62 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00089207  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>