More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4079 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4079  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 215 aa  431  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0325691  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  52.02 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  54.19 
 
 		 199 aa  147  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8239  putative phosphoglycerate mutase  49.15 
 
 		 194 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  normal  0.860481 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  40.91 
 
 		 205 aa  108  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.31 
 
 		 369 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  34.05 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.68 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 		 212 aa  101  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  40.59 
 
 		 210 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  44.87 
 
 		 378 aa  98.6  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 209 aa  98.6  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.54 
 
 		 213 aa  96.7  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  37.79 
 
 		 235 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  38.79 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 		 210 aa  95.5  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.94 
 
 		 378 aa  94.7  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 212 aa  94.7  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  36.95 
 
 		 237 aa  94.7  9e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.12 
 
 		 356 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.16 
 
 		 427 aa  91.3  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  41.14 
 
 		 440 aa  91.3  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.5 
 
 		 365 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.5 
 
 		 365 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  35.68 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.5 
 
 		 365 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  41.46 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 192 aa  89.7  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  35.03 
 
 		 218 aa  89  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.78 
 
 		 378 aa  88.2  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  39.29 
 
 		 402 aa  88.2  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  42.69 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  41.72 
 
 		 411 aa  87.8  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.41 
 
 		 382 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 207 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 370 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  37.95 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  36.72 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.74 
 
 		 442 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35.88 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 240 aa  85.9  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 200 aa  86.3  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  40.13 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 220 aa  85.9  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  40.99 
 
 		 363 aa  85.5  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 207 aa  84.7  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 		 229 aa  84.7  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  38.95 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.87 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  35.5 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  31.17 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.87 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  37.65 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  37.65 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20020  fructose-2,6-bisphosphatase  34.44 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  33.54 
 
 		 200 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.4 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  39.74 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  34.69 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  37.65 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  37.65 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  38.65 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  37.74 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  38.69 
 
 		 412 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>