299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1207 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  100 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  68.53 
 
 		 197 aa  277  8e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  67.35 
 
 		 197 aa  271  5.000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  67.86 
 
 		 197 aa  251  7e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  69.04 
 
 		 198 aa  249  2e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  44.35 
 
 		 198 aa  111  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  45.67 
 
 		 253 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  45.67 
 
 		 253 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  44.88 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  43.08 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  44.88 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.15 
 
 		 369 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  47.24 
 
 		 383 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  45.67 
 
 		 356 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  44.44 
 
 		 133 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  40.62 
 
 		 154 aa  99.8  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.46 
 
 		 365 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.46 
 
 		 365 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.46 
 
 		 365 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  44.09 
 
 		 137 aa  98.6  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  48.8 
 
 		 132 aa  97.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  42.64 
 
 		 370 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  43.08 
 
 		 391 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.44 
 
 		 427 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  39.84 
 
 		 194 aa  91.7  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  43.08 
 
 		 401 aa  89.4  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.33 
 
 		 364 aa  89  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  43.75 
 
 		 142 aa  89  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  39.84 
 
 		 134 aa  88.6  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  39.84 
 
 		 363 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.86 
 
 		 382 aa  84.7  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  42.28 
 
 		 126 aa  84.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  42.54 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  35.16 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  41.38 
 
 		 412 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  40.77 
 
 		 452 aa  81.6  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.6 
 
 		 378 aa  81.3  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0891  ribonuclease H  38.97 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000481849  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  41.35 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  43.08 
 
 		 378 aa  79  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  36.22 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  36.22 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  36.22 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  36.22 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  36.22 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  36.22 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  36.22 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  36.22 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  38.1 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  36.22 
 
 		 128 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  36.22 
 
 		 128 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.88 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  36.22 
 
 		 132 aa  72  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  40.62 
 
 		 366 aa  71.2  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  40.19 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  36.22 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3678  ribonuclease H  37.9 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  38.52 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  42.61 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2706  ribonuclease HI  36.57 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  38.32 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5423  ribonuclease H  30.77 
 
 		 2805 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  32.61 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  38.96 
 
 		 81 aa  62.4  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2333  ribonuclease H  33.79 
 
 		 153 aa  62  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  33.87 
 
 		 148 aa  62  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  32.91 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2679  hypothetical protein  32.03 
 
 		 149 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.207946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3313  Ribonuclease H  32.65 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1544  ribonuclease H  37.1 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  39.22 
 
 		 412 aa  59.3  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1103  ribonuclease H  35.92 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1024  ribonuclease H  34.25 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2382  ribonuclease H  33.33 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.227808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3014  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1829  Ribonuclease H  35.42 
 
 		 163 aa  57  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5812  ribonuclease H  36.43 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0263  ribonuclease H  32.19 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.988009  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  33.1 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1663  ribonuclease HI  33.33 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.835825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1172  RNase HI  33.79 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000482938  hitchhiker  0.000107341 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6005  ribonuclease H  35.92 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.266469  normal  0.0613425 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2456  ribonuclease H  31.62 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000408734  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0162  ribonuclease H  33.59 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.765291  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0841  ribonuclease H  32.88 
 
 		 154 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5247  ribonuclease H  35.17 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.021715 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2729  ribonuclease H  34.06 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1733  ribonuclease H  35.17 
 
 		 148 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0373271  normal  0.553934 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1717  hypothetical protein  26.67 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0950  ribonuclease H  35.71 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.909306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2041  ribonuclease H  35.17 
 
 		 148 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2183  RNase HI  44 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1768  hypothetical protein  25.33 
 
 		 219 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1923  hypothetical protein  35 
 
 		 124 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  35.21 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1472  hypothetical protein  25.97 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0667267  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6404  ribonuclease H  37.01 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1513  ribonuclease H  35.17 
 
 		 151 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1510  hypothetical protein  25.32 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00387825  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1985  ribonuclease H  32.06 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000102134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>