144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1173 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  100 
 
 		 194 aa  389  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  43.38 
 
 		 391 aa  122  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.6 
 
 		 369 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  40.94 
 
 		 254 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  42.75 
 
 		 137 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.85 
 
 		 365 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.85 
 
 		 365 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.85 
 
 		 365 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  43.24 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  43.41 
 
 		 383 aa  112  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.85 
 
 		 356 aa  112  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  40.8 
 
 		 253 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  40.8 
 
 		 253 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  38.35 
 
 		 133 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  40.32 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  41.98 
 
 		 401 aa  107  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 378 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 370 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 363 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  40.46 
 
 		 134 aa  102  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0307  ribonuclease H  44.8 
 
 		 198 aa  101  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483531  normal  0.133717 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 		 411 aa  101  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 440 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  41.6 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.26 
 
 		 382 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  37.4 
 
 		 142 aa  99.4  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.89 
 
 		 378 aa  99  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3066  ribonuclease H  42.4 
 
 		 197 aa  99  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.16 
 
 		 364 aa  99  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.1 
 
 		 378 aa  98.2  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 		 412 aa  97.8  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1207  ribonuclease H  39.84 
 
 		 198 aa  97.8  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.623117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  39.55 
 
 		 452 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  35.29 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0273  ribonuclease H  36.23 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.442052 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  41.6 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  34.65 
 
 		 132 aa  89  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  41.6 
 
 		 126 aa  88.2  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1556  ribonuclease H  34.33 
 
 		 154 aa  87.8  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  36.64 
 
 		 313 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36 
 
 		 427 aa  85.5  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  33.6 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0891  ribonuclease H  37.04 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000481849  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 		 402 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  34.85 
 
 		 322 aa  82.4  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2246  ribonuclease H  37.62 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.454266  hitchhiker  0.00558183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  38.64 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1384  ribonuclease H  37.5 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000297522  normal  0.0974241 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  35.03 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1494  ribonuclease HI-like protein  33.08 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1523  cell wall enzyme EbsB-like protein  33.08 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1659  ribonuclease H  33.6 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0755  ribonuclease H  36.84 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1739  ribonuclease H  33.33 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3686  ribonuclease H  32.8 
 
 		 128 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1507  ribonuclease H  33.6 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154528  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1479  ribonuclease H  33.6 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.221091  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1469  ribonuclease H  33.6 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.718462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1623  ribonuclease H  33.6 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1764  ribonuclease H  33.6 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1691  ribonuclease H  33.6 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1511  ribonuclease H  33.6 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1714  ribonuclease H  33.6 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461816  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1321  ribonuclease H  33.6 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00120412  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4711  ribonuclease H  33.08 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.42605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1010  cell wall enzyme EbsB, putative  31.01 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_303  hypothetical protein  43.06 
 
 		 81 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1717  hypothetical protein  28.89 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.387323  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3678  ribonuclease H  29.01 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66661  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1351  ribonuclease H  29.37 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1663  hypothetical protein  29.63 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1514  hypothetical protein  29.71 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1923  hypothetical protein  33.07 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5423  ribonuclease H  31.01 
 
 		 2805 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0317  Ribonuclease H  32.41 
 
 		 163 aa  57.8  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1510  hypothetical protein  28.15 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00387825  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1626  hypothetical protein  28.15 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1768  hypothetical protein  28.15 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1472  hypothetical protein  28.15 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0667267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1694  hypothetical protein  28.15 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3682  hypothetical protein  28.15 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3014  hypothetical protein  27.48 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157547  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1482  hypothetical protein  27.41 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00299732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1324  hypothetical protein  28.79 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000515383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8140  ribonuclease H  37.78 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4830  ribonuclease H  28.47 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.935261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2679  hypothetical protein  27.07 
 
 		 149 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.207946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1544  ribonuclease H  27.48 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2143  hypothetical protein  30.71 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10510  ribonuclease HI  38.1 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000169175 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0660  Ribonuclease H  29.93 
 
 		 153 aa  48.9  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.489941  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2924  ribonuclease H  29.37 
 
 		 159 aa  48.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3655  ribonuclease H  38.16 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00499502  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0162  ribonuclease H  32.03 
 
 		 142 aa  47.8  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.765291  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1354  Ribonuclease HI-like protein  24.83 
 
 		 417 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.384272  hitchhiker  0.000000713582 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1973  ribonuclease H  28.48 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1325  hypothetical protein  24.83 
 
 		 417 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1942  ribonuclease H  27.59 
 
 		 164 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1094  ribonuclease H  29.41 
 
 		 158 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0989345  hitchhiker  0.0000000000000128694 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4395  ribonuclease H  27.08 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.480095 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>